Bsr, a nuclear-retained RNA with monoallelic expression
| Autor: | Jérôme Cavaillé, Maud Marques, Eugenia Basyuk, Edouard Bertrand, Virginie Marty, Hélène Royo |
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| Přispěvatelé: | Laboratoire de biologie moléculaire eucaryote du CNRS ( LBME ), Université Paul Sabatier - Toulouse 3 ( UPS ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Institut de Génomique Fonctionnelle ( IGF ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques ( UM2 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Université Montpellier 1 ( UM1 ) -Université de Montpellier ( UM ), Institut de Génétique Moléculaire de Montpellier ( IGMM ), Université de Montpellier ( UM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Institut de Biologie du Développement de Marseille ( IBDM ), Aix Marseille Université ( AMU ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Centre de Recherches sur la Cognition Animale [Toulouse] ( CRCA ), Institut de minéralogie et de physique des milieux condensés ( IMPMC ), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -IPG PARIS-Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Departament Geodinàmica i Geofísica, Facultat de Geologia, Laboratoire de Physique Statistique de l'ENS ( LPS ), Fédération de recherche du Département de physique de l'Ecole Normale Supérieure - ENS Paris ( FRDPENS ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -École normale supérieure - Paris ( ENS Paris ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -École normale supérieure - Paris ( ENS Paris ) -Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire Colloïdes et Matériaux Divisés ( LCMD ), ESPCI ParisTech-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Liquides Ioniques et Interfaces Chargées ( LI2C ), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -ESPCI ParisTech-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Ecole Nationale de la Santé Publique ( ENSP ), École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] ( EHESP ), Centre de recherches Paul Pascal ( CRPP ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire de biologie moléculaire eucaryote (LBME), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Génomique Fonctionnelle (IGF), Université de Montpellier (UM)-Université Montpellier 1 (UM1)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Génétique Moléculaire de Montpellier (IGMM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM), Institut de Biologie du Développement de Marseille (IBDM), Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de Recherches sur la Cognition Animale (CRCA), Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut des sciences du cerveau de Toulouse. (ISCT), Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-CHU Toulouse [Toulouse]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-CHU Toulouse [Toulouse]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Département de biologie [Sherbrooke] (UdeS), Faculté des sciences [Sherbrooke] (UdeS), Université de Sherbrooke (UdeS)-Université de Sherbrooke (UdeS), Laboratoire de Physique Statistique de l'ENS (LPS), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Fédération de recherche du Département de physique de l'Ecole Normale Supérieure - ENS Paris (FRDPENS), École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Colloïdes et Matériaux Divisés (LCMD), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ecole Superieure de Physique et de Chimie Industrielles de la Ville de Paris (ESPCI Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL), Liquides Ioniques et Interfaces Chargées (LI2C), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Ecole Superieure de Physique et de Chimie Industrielles de la Ville de Paris (ESPCI Paris), Ecole Nationale de la Santé Publique (ENSP), École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP), Centre de recherches Paul Pascal (CRPP), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Montpellier 1 (UM1)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de Recherches sur la Cognition Animale - UMR5169 (CRCA), Institut des sciences du cerveau de Toulouse. (ISCT), Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J), Université de Toulouse (UT)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Fédération de recherche du Département de physique de l'Ecole Normale Supérieure - ENS Paris (FRDPENS), École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Ecole Superieure de Physique et de Chimie Industrielles de la Ville de Paris (ESPCI Paris) |
| Jazyk: | angličtina |
| Rok vydání: | 2007 |
| Předmět: |
MESH: Hydroxamic Acids
RNA Untranslated MESH : RNA Messenger MESH: Introns RNA Stability Hydroxamic Acids RNA Transport MESH: RNA Untranslated 0302 clinical medicine MESH: RNA Transport Transcription (biology) Gene cluster MESH : RNA MESH: Animals MESH : Cell Nucleus Structures MESH : Female MESH : RNA Transport Genetics 0303 health sciences MESH : Cell Nucleus MESH : Rats MESH: RNA Stability Articles MESH : RNA Stability Non-coding RNA medicine.anatomical_structure RNA splicing Female MESH : RNA Splicing MESH: Cell Nucleus MESH : RNA Untranslated MESH: Rats RNA Splicing MESH: Cytoplasmic Granules Biology Cytoplasmic Granules MESH : Rats Wistar MESH : Introns 03 medical and health sciences MESH: RNA MESH : Fibroblasts medicine Animals [SDV.BBM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry Molecular Biology MESH: Cell Nucleus Structures RNA Messenger Rats Wistar Molecular Biology Gene [ SDV.BBM ] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry Molecular Biology Alleles MESH: RNA Messenger 030304 developmental biology Cell Nucleus MESH : Hydroxamic Acids MESH: Alleles MESH : Cytoplasmic Granules Intron RNA MESH: Rats Wistar Cell Biology Fibroblasts Cell Nucleus Structures Introns Rats Cell nucleus MESH: Fibroblasts MESH : Animals MESH: RNA Splicing MESH : Alleles MESH: Female 030217 neurology & neurosurgery |
| Zdroj: | Molecular Biology of the Cell Molecular Biology of the Cell, American Society for Cell Biology, 2007, 18 (8), pp.2817-27. 〈10.1091/mbc.E06-10-0920〉 Molecular Biology of the Cell, American Society for Cell Biology, 2007, 18 (8), pp.2817-27. ⟨10.1091/mbc.E06-10-0920⟩ Molecular Biology of the Cell, 2007, 18 (8), pp.2817-27. ⟨10.1091/mbc.E06-10-0920⟩ |
| ISSN: | 1059-1524 1939-4586 |
| DOI: | 10.1091/mbc.E06-10-0920〉 |
| Popis: | The imprinted Dlk1-Gtl2 and Prader-Willi syndrome (PWS) regions are characterized by a complex noncoding transcription unit spanning arrays of tandemly repeated C/D RNA genes. These noncoding RNAs (ncRNAs) are thought to play an essential but still poorly understood role. To better understand the intracellular fate of these large ncRNAs, fluorescence in situ hybridization was carried out at the rat Dlk1-Gtl2 domain. This locus contains a ∼100-kb-long gene cluster comprising 86 homologous RBII-36 C/D RNA gene copies, all of them intron-encoded within the ncRNA gene Bsr. Here, we demonstrate that the Bsr gene is monoallelically expressed in primary rat embryonic fibroblasts as well as in hypothalamic neurons and yields a large amount of unspliced and spliced RNAs at the transcription site, mostly as elongated RNA signals. Surprisingly, spliced Bsr RNAs released from the transcription site mainly concentrate as numerous, stable nuclear foci that do not colocalize with any known subnuclear structures. On drug treatments, a fraction of Bsr RNA relocalizes to the cytoplasm and associates with stress granules (SGs), but not with P-bodies, pointing to a potential link between SGs and the metabolism of ncRNA. Thus, Bsr might represent a novel type of nuclear-retained transcript. |
| Databáze: | OpenAIRE |
| Externí odkaz: |
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