Associations between untargeted plasma metabolomic signatures and gut microbiota composition in the Milieu Intérieur population of healthy adults

Autor: Partula, Valentin, Deschasaux-Tanguy, Mélanie, Mondot, Stanislas, Victor-Bala, Agnès, Bouchemal, Nadia, Lecuyer, Lucie, Bobin-Dubigeon, Christine, Torres, Marion, Kesse-Guyot, Emmanuelle, Charbit, Bruno, Patin, Etienne, Assmann, Karen, Latino-Martel, Paule, Julia, Chantal, Galan, Pilar, Hercberg, Serge, Quintana-Murci, Lluis, Albert, Matthew, Duffy, Darragh, Lantz, Olivier, Savarin, Philippe, Nawfal Triba, Mohamed, Touvier, Mathilde, The Milieu Interieur, Consortium
Přispěvatelé: Deschasaux-Tanguy, Mélanie, Laboratoires d'excellence - GENETIC & ENVIRONMENTAL CONTROL OF IMMUNE PHENOTYPE VARIANCE: ESTABLISHING A PATH TOWARDS PERSONALIZED MEDICINE - - MILIEU INTERIEUR2010 - ANR-10-LABX-0069 - LABX - VALID, Equipe 3: EREN- Equipe de Recherche en Epidémiologie Nutritionnelle (CRESS - U1153), Université Sorbonne Paris Nord-Centre de Recherche Épidémiologie et Statistique Sorbonne Paris Cité (CRESS (U1153 / UMR_A_1125 / UMR_S_1153)), Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM), HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM), HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université Paris Diderot, Sorbonne Paris Cité, Paris, France, Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), MICrobiologie de l'ALImentation au Service de la Santé (MICALIS), AgroParisTech-Université Paris-Saclay-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Chimie, Structures et Propriétés de Biomatériaux et d'Agents Thérapeutiques (CSPBAT), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Sorbonne Paris Nord, Institut de Cancérologie de l'Ouest [Angers/Nantes] (UNICANCER/ICO), UNICANCER, Mer, molécules et santé EA 2160 (MMS), Le Mans Université (UM)-Université de Nantes - UFR des Sciences et des Techniques (UN UFR ST), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-Université de Nantes - UFR des Sciences Pharmaceutiques et Biologiques, Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN), Centre de Recherche Translationnelle - Center for Translational Science (CRT), Institut Pasteur [Paris] (IP), Génétique Evolutive Humaine - Human Evolutionary Genetics, Institut Pasteur [Paris] (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Département de Santé Publique [Avicenne], Hôpital Avicenne [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Insitro [San Francisco], CIC1428 IGR-CURIE, Institut Curie [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), ANR-10-LABX-0069,MILIEU INTERIEUR,GENETIC & ENVIRONMENTAL CONTROL OF IMMUNE PHENOTYPE VARIANCE: ESTABLISHING A PATH TOWARDS PERSONALIZED MEDICINE(2010), Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Paris (UP)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Paris (UP)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université de Nantes - UFR des Sciences Pharmaceutiques et Biologiques, Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-Le Mans Université (UM)-Université de Nantes - UFR des Sciences et des Techniques (UN UFR ST), Institut Pasteur [Paris], Institut Pasteur [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Immunobiologie des Cellules dendritiques, Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Jazyk: angličtina
Rok vydání: 2020
Předmět:
0301 basic medicine
Epidemiology
Population
False discovery rate
Medicine (miscellaneous)
Faecalibacterium prausnitzii
Gut microbiota
Gut flora
FDR
03 medical and health sciences
NMR metabolomics
0302 clinical medicine
Metabolomics
Species level
Negatively associated
epidemiology
Cross-sectional population-based studies
host-gut microbiota relationships
education
Host–gut microbiota relationships
Metabolomic signatures and gut microbiota Gut microbiota
Genetics
education.field_of_study
CPMG
Nutrition and Dietetics
biology
Mass spectrometry
cross-sectional population-based study
biology.organism_classification
[SDV.AEN] Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition
030104 developmental biology
epidemiology. Study registration: NCT01699893 Carr-Purcell-Meiboom-Gill
[SDV.SPEE] Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie
030220 oncology & carcinogenesis
Composition (visual arts)
[SDV.SPEE]Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie
Species richness
[SDV.AEN]Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition
Zdroj: British Journal of Nutrition
British Journal of Nutrition, 2020, 126 (7), pp. 982-992. ⟨10.1017/S0007114520004870⟩
British Journal of Nutrition, 2021, 126 (7), pp. 982-992. ⟨10.1017/S0007114520004870⟩
British Journal of Nutrition, Cambridge University Press (CUP), 2020, pp.1-29. ⟨10.1017/S0007114520004870⟩
ISSN: 0007-1145
1475-2662
Popis: Host–microbial co-metabolism products are being increasingly recognised to play important roles in physiological processes. However, studies undertaking a comprehensive approach to consider host–microbial metabolic relationships remain scarce. Metabolomic analysis yielding detailed information regarding metabolites found in a given biological compartment holds promise for such an approach. This work aimed to explore the associations between host plasma metabolomic signatures and gut microbiota composition in healthy adults of the Milieu Intérieur study. For 846 subjects, gut microbiota composition was profiled through sequencing of the 16S rRNA gene in stools. Metabolomic signatures were generated through proton NMR analysis of plasma. The associations between metabolomic variables and α- and β-diversity indexes and relative taxa abundances were tested using multi-adjusted partial Spearman correlations, permutational ANOVA and multivariate associations with linear models, respectively. A multiple testing correction was applied (Benjamini–Hochberg, 10 % false discovery rate). Microbial richness was negatively associated with lipid-related signals and positively associated with amino acids, choline, creatinine, glucose and citrate (−0·133 ≤ Spearman’s ρ ≤ 0·126). Specific associations between metabolomic signals and abundances of taxa were detected (twenty-five at the genus level and nineteen at the species level): notably, numerous associations were observed for creatinine (positively associated with eleven species and negatively associated with Faecalibacterium prausnitzii). This large-scale population-based study highlights metabolites associated with gut microbial features and provides new insights into the understanding of complex host–gut microbiota metabolic relationships. In particular, our results support the implication of a ‘gut–kidney axis’. More studies providing a detailed exploration of these complex interactions and their implications for host health are needed.
Databáze: OpenAIRE