Systematic and Evolution of Microorganisms: General Concepts

Autor: Jean-Claude Bertrand, Télesphore Sime-Ngando, Pierre Caumette, Charles-François Boudouresque, Philippe Normand
Přispěvatelé: Institut méditerranéen d'océanologie (MIO), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Toulon (UTLN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut des sciences analytiques et de physico-chimie pour l'environnement et les materiaux (IPREM), Université de Pau et des Pays de l'Adour (UPPA)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de MicrobiologiE de Géochimie et d'Ecologie Marines (LMGEM), Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'Ecologie Microbienne - UMR 5557 (LEM), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Microorganismes : Génome et Environnement (LMGE), Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 (UBP)-Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Jean-Claude Bertrand, Pierre Caumette, Philippe Lebaron, Robert Matheron, Philippe Normand, Télesphore Sime-Ngando, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Toulon (UTLN)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Université de Pau et des Pays de l'Adour (UPPA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS), Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 (UBP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Toulon (UTLN), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL)
Jazyk: angličtina
Rok vydání: 2015
Předmět:
Zdroj: Environmental Microbiology: Fundamentals and Applications
Jean-Claude Bertrand; Pierre Caumette; Philippe Lebaron; Robert Matheron; Philippe Normand; Télesphore Sime-Ngando. Environmental Microbiology: Fundamentals and Applications, Springer Netherlands, pp.107-144, 2015, 978-94-017-9118-2. ⟨10.1007/978-94-017-9118-2_5⟩
Environmental Microbiology: Fundamentals and Applications ISBN: 9789401791175
DOI: 10.1007/978-94-017-9118-2_5⟩
Popis: International audience; The diversity of metabolic activities is a characteristic of the microbial world. This enormous diversity needs to be structured in order to be understood, and as a result, taxonomy and systematics are constantly changing since the beginning of the history of microbiology and particularly today with the introduction in the last 20 years of phylogeny as the core of systematics. The history of concepts in systematics and classification is presented. Classification is the science of ordering microorganism groups (taxa) based on their interrelationships. Taxonomy is the discipline that defines the principles and laws of classification. Nomenclature is the science of defining and naming the taxonomic categories (species, genera, families, orders, classes, divisions, phyla, kingdoms, domains), according to their hierarchical rank. In this way, different schools of classification and bacterial systematics were developed in the twentieth century. Today, there is an international consensus based on the classification of the Bergey’s Manual revisited with the concepts of phylogeny. Through this classification, the concept of the prokaryotic world organization has evolved. From the idea of a kingdom of prokaryotes, the concept of three domains in the organization of life supported by phylogenetic trees is fully accepted today. Among these three domains, two are prokaryotic: Bacteria and Archaea. In this chapter, the role of horizontal gene transfers in the evolution of life is discussed. The origin of eukaryotes with the primary, secondary, and tertiary endosymbioses is also presented. This allows to improve or to transform the concept of the tree of life from phylogeny to full genome study.
Databáze: OpenAIRE
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