Mapping the Epigenetic Basis of Complex Traits
Autor: | Vincent Colot, Frank Johannes, Sandra Cortijo, Erwann Caillieux, Mathilde Etcheverry, Karine Labadie, François Roudier, Ritsert C. Jansen, Arthur Gilly, Jean-Marc Aury, Maria Colomé-Tatché, René Wardenaar, Patrick Wincker |
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Přispěvatelé: | Institut de biologie de l'ENS Paris (IBENS), Département de Biologie - ENS Paris, École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Groningen Bioinformatics Centre, GBB, University of Groningen [Groningen], Institut de Génomique d'Evry (IG), Université Paris-Saclay-Institut de Biologie François JACOB (JACOB), Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Génomique métabolique (UMR 8030), Genoscope - Centre national de séquençage [Evry] (GENOSCOPE), Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE), Netherlands Organization for Scientific Research, University of Groningen, Agence Nationale de la Recherche [ANR-09-BLAN-0237 EPIMOBILE, ANR-06-GPLA-010 TAG, ANR-10-LABX-54 MEMO LIFE, ANR-11-IDEX-0001-02 PSL*], European Union (EpiGeneSys FP7 Network of Excellence) [257082], Ministere de l'Enseignement Superieur et de la Recherche, Fondation pour la Recherche Medicale, Institut de biologie de l'ENS Paris (UMR 8197/1024) (IBENS), École normale supérieure - Paris (ENS Paris)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Biologie François JACOB (JACOB), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Département de Biologie - ENS Paris, École normale supérieure - Paris (ENS Paris)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Département de Biologie - ENS Paris, École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE), Bioinformatics, Stem Cell Aging Leukemia and Lymphoma (SALL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE) |
Jazyk: | angličtina |
Rok vydání: | 2014 |
Předmět: |
0106 biological sciences
[SDV]Life Sciences [q-bio] Quantitative Trait Loci Population Arabidopsis Population genetics Biology Quantitative trait locus 01 natural sciences Genome Epigenesis Genetic 03 medical and health sciences Gene Expression Regulation Plant PLANTS Epigenetics Selection Genetic education DNA METHYLATION 030304 developmental biology Genetics 0303 health sciences education.field_of_study Multidisciplinary ANIMALS Chromosome Mapping Heritability Differentially methylated regions DNA methylation ARABIDOPSIS-THALIANA PATTERNS 010606 plant biology & botany |
Zdroj: | Science Science, 2014, 343 (6175), pp.1145-1148. ⟨10.1126/science.1248127⟩ Science, American Association for the Advancement of Science, 2014, 343 (6175), pp.1145-1148. ⟨10.1126/science.1248127⟩ Science; Vol 343 Science, 343(6175), 1145-1148. AMER ASSOC ADVANCEMENT SCIENCE |
ISSN: | 1095-9203 0036-8075 |
Popis: | Quantifying the impact of heritable epigenetic variation on complex traits is an emerging challenge in population genetics. Here, we analyze a population of isogenic Arabidopsis lines that segregate experimentally induced DNA methylation changes at hundreds of regions across the genome. We demonstrate that several of these differentially methylated regions (DMRs) act as bona fide epigenetic quantitative trait loci (QTL epi ), accounting for 60 to 90% of the heritability for two complex traits, flowering time and primary root length. These QTL epi are reproducible and can be subjected to artificial selection. Many of the experimentally induced DMRs are also variable in natural populations of this species and may thus provide an epigenetic basis for Darwinian evolution independently of DNA sequence changes. |
Databáze: | OpenAIRE |
Externí odkaz: |