Estimating the genetic diversity and structure ofQuercus trojanaWebb populations in Italy by SSRs: implications for management and conservation
Autor: | Fiorella Villani, Chiara Mattia, Claudia Mattioni, Carla Caruso, Tommaso La Mantia, Laura Bertini, Francesca Chiocchini, M. Cherubini, Maddalena Carabeo, Marco Cosimo Simeone |
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Přispěvatelé: | Carabeo, M., Simeone, M., Cherubini, M., Mattia, C., Chiocchini, F., Bertini, L., Caruso, C., La Mantia, T., Villani, F., Mattioni, C. |
Rok vydání: | 2017 |
Předmět: |
0106 biological sciences
0301 basic medicine Settore AGR/05 - Assestamento Forestale E Selvicoltura Quercus trojana Genetic diversity Population structure SSRs markers Conservation Quercus trojana Range (biology) Population Conservation Population structure 010603 evolutionary biology 01 natural sciences Genetic diversity 03 medical and health sciences education Abiotic component Quercus trojana diversité génétique structure de populations marqueurs SSRs conservation Global and Planetary Change education.field_of_study SSRs markers Ecology biology Forestry biology.organism_classification 030104 developmental biology Microsatellite Gene pool Species richness |
Zdroj: | Canadian journal of forest research (Online) (2017): 331–339. doi:10.1139/cjfr-2016-0311 info:cnr-pdr/source/autori:Maddalena Carabeo, Marco Cosimo Simeone, Marcello Cherubini, Chiara Mattia, Francesca Chiocchini, Laura Bertini, Carla Caruso,Tommaso La Mantia, Fiorella Villani, Claudia Mattioni/titolo:Estimating the genetic diversity and structure of Quercus trojana Webb populations in Italy by SSRs: implications for management and conservation/doi:10.1139%2Fcjfr-2016-0311/rivista:Canadian journal of forest research (Online)/anno:2017/pagina_da:331/pagina_a:339/intervallo_pagine:331–339/volume |
ISSN: | 1208-6037 0045-5067 |
DOI: | 10.1139/cjfr-2016-0311 |
Popis: | Studying the genetic diversity and structure of the current forest populations is essential for evaluating the ability to survive to future biotic and abiotic changes and planning conservation strategies. Quercus trojana is an eastern Mediterranean tree species with a fragmented distribution range, and its westernmost outposts are located in southern Italy. The demand for timber and cropland over the centuries has severely reduced it s occurrence in this part of the range. We assessed the genetic diversity and structure of the extant Italian populations of Q. trojana and derived conservation guidelines. A total of 322 samples were genotyped with six polymorphic nuclear microsatellite markers. Our results reveale d a high genetic diversity in all populations, structured into two main gene pools, and a highly divergent single population. Based on the allelic richness and heterozygosity estimation, we identified populations which can be considered as valuable source material for conservation programs, and those requiring adequate measure to reestablish gene flow and reduce fragmentation. Finally, a comparison with a set of eastern Mediterranean samples indicated a relationship between the Italian and the Greek gene pool; different hypotheses on the Italian gene pool origin were discussed. The need to protect these marginal, disjunct populations was further reinforced. ` survivre aux changements biotiques et abiotiques futurs et planifier les stratégies de conservation. Quercus trojana Webb est une espèce arborescente de l’est de la région méditerranéenne caractérisée par une aire de distribution naturelle fragmentée. Ses avant-postes les plus a` l’ouest sont situés dans le sud de l’Italie. Au cours des siècles, la demande pour le bois et les terres destinées a` l’agriculture a sévèrement réduit son occurrence dans cette partie de son aire de distribution. Nous avons évalué la diversité génétique et la structure des populations actuelles de Q. trojana en Italie, afin d’en déduire des lignes directrices pour la conservation. Un total de 322 échantillons ont été génotypés pour six marqueurs nucléaires polymorphes de type microsatellite. Les résultats indiquent qu’il y a une grande diversité génétique dans toutes les populations, structurée en deux pools génétiques principaux, ainsi qu’une population unique très divergente. Sur la base des estimations de richesse allélique et d’hétérozygotie, les populations pouvant être considérées comme une source utile de propagules pour les programmes de conservation ont été identifiées, ainsi que les populations nécessitant des mesures adéquates pour restaurer le flux génique et réduire la fragmentation. Enfin, la comparaison avec un jeu d’échantillons provenant de l’est de la région méditerranéenne montre qu’il existe un lien entre le pool génétique de l’Italie et celui de la Grèce. Différentes hypothèses concernant l’origine du pool génétique italien sont abordées dans la discussion. La protection de ces populations marginales disjointes a encore besoin d’être renforcée. |
Databáze: | OpenAIRE |
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