Genomic and phylogenetic analysis of hepatitis C virus isolates from Argentine patients: A six-year retrospective study
| Autor: | Jorge Quarleri, Luis Alberto Espínola, Mariana Feld, Jose Raul Oubiña, Oscar Gaspar Mandó, Guadalupe Carballal, M.P. Requeijo, Veronica Lidia Mathet, Betty H. Robertson |
|---|---|
| Jazyk: | angličtina |
| Rok vydání: | 2000 |
| Předmět: |
Adult
Male Microbiology (medical) Adolescent Genotype Hepatitis C virus Population HCV genotypes Argentina Hepacivirus medicine.disease_cause Polymerase Chain Reaction Flaviviridae Virology medicine Humans Typing Child Substance Abuse Intravenous Clade education Phylogeny Aged Retrospective Studies Genetics education.field_of_study Phylogenetic analysis Phylogenetic tree biology Errata purl.org/becyt/ford/3.1 [https] Middle Aged biology.organism_classification Liver Child Preschool Female purl.org/becyt/ford/3 [https] Restriction fragment length polymorphism 5' Untranslated Regions Polymorphism Restriction Fragment Length |
| Zdroj: | CONICET Digital (CONICET) Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas instacron:CONICET |
| Popis: | Typing of hepatitis C virus (HCV) isolates from Argentine patients was performed by using different methodologies in a population of 243 patients. HCV subtype was assigned based upon restriction fragment length polymorphism (RFLP). HCV RNA genomes obtained from serum samples were classified as belonging to clade 1 (53.5%), 2 (23.0%), or 3 (8.6%); 14.8% of samples showed HCV mixed infections, more frequently implying different subtypes within the same clade. In addition to RFLP typing, phylogenetic relatedness among sequences from both 5′ untranslated region (n = 50) and nonstructural 5B coding region (n = 15) was established. Fil: Quarleri, Jorge Fabian. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Departamento de Microbiología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay; Argentina Fil: Robertson, B.H.. Centers For Disease Control And Prevention. National Center For Infectious Diseases; Estados Unidos Fil: Mathet, Veronica Lidia. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Departamento de Microbiología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; Argentina Fil: Feld, Mariana. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Departamento de Microbiología; Argentina Fil: Espínola, Luis Alberto. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Departamento de Microbiología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay; Argentina Fil: Requeijo, M.P.. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. CEMIC-CONICET. Centro de Educaciones Médicas e Investigaciones Clínicas "Norberto Quirno". CEMIC-CONICET; Argentina Fil: Mandó, Oscar Gaspar. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. CEMIC-CONICET. Centro de Educaciones Médicas e Investigaciones Clínicas "Norberto Quirno". CEMIC-CONICET; Argentina Fil: Carballal, Guadalupe. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. CEMIC-CONICET. Centro de Educaciones Médicas e Investigaciones Clínicas "Norberto Quirno". CEMIC-CONICET; Argentina Fil: Oubiña, Jose Raul. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Departamento de Microbiología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; Argentina |
| Databáze: | OpenAIRE |
| Externí odkaz: |
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