Comparative genomics of 10 new Caenorhabditis species

Autor: Lise Frézal, Sarah Fausett, Carlos Caurcel, Matthew D. Newton, Walter Sudhaus, Toni Beltran, Matthew V. Rockman, David H. A. Fitch, Marie-Anne Félix, Charlie Gosse, Aurélien Richaud, Karin Kiontke, Mark Blaxter, Lewis Stevens, Luke M. Noble, Christian Braendle, Taniya Kaur
Přispěvatelé: Institut Jacques Monod (IJM (UMR_7592)), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Biologie Valrose (IBV), Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Côte d'Azur (UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de biologie de l'ENS Paris (IBENS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Département de Biologie - ENS Paris, École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de photonique et de nanostructures (LPN), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), New york University, Department of Biology, New York University [New York] (NYU), NYU System (NYU)-NYU System (NYU), Génétique évolutive expérimentale - Equipe de l'IBENS, Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Département de Biologie - ENS Paris, Institute of Evolutionary Biology, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), Université Côte d'Azur (UCA)-Université Côte d'Azur (UCA), Institut de biologie de l'ENS Paris (UMR 8197/1024) (IBENS), Département de Biologie - ENS Paris, École normale supérieure - Paris (ENS Paris)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), École normale supérieure - Paris (ENS Paris)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Département de Biologie - ENS Paris, Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Département de Biologie - ENS Paris
Jazyk: angličtina
Rok vydání: 2019
Předmět:
Zdroj: Evolution Letters
Evolution Letters, Wiley Open Access 2019, 3 (2), pp.217-236. ⟨10.1002/evl3.110⟩
Evolution Letters, Vol 3, Iss 2, Pp 217-236 (2019)
Stevens, L, Félix, M, Beltran, T, Braendle, C, Caurcel, C, Fausett, S, Fitch, D, Frézal, L, Gosse, C, Kaur, T, Kiontke, K, Newton, M D, Noble, L M, Richaud, A, Rockman, M V, Sudhaus, W & Blaxter, M 2019, ' Comparative genomics of 10 new Caenorhabditis species ', Evolution Letters, vol. 3, no. 2, pp. 217-236 . https://doi.org/10.1002/evl3.2019.3.issue-2
ISSN: 2056-3744
Popis: The nematode Caenorhabditis elegans has been central to the understanding of metazoan biology. However, C. elegans is but one species among millions and the significance of this important model organism will only be fully revealed if it is placed in a rich evolutionary context. Global sampling efforts have led to the discovery of over 50 putative species from the genus Caenorhabditis, many of which await formal species description. Here, we present species descriptions for 10 new Caenorhabditis species. We also present draft genome sequences for nine of these new species, along with a transcriptome assembly for one. We exploit these whole-genome data to reconstruct the Caenorhabditis phylogeny and use this phylogenetic tree to dissect the evolution of morphology in the genus. We reveal extensive variation in genome size and investigate the molecular processes that underlie this variation. We show unexpected complexity in the evolutionary history of key developmental pathway genes. These new species and the associated genomic resources will be essential in our attempts to understand the evolutionary origins of the C. elegans model.
Databáze: OpenAIRE
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