Incidence of viruses in grapevines in the Brazilian Northeast and partial molecular characterization of local virus isolates
Autor: | Osmar Nickel, Gilvan Pio-Ribeiro, Thor Vinícius Martins Fajardo, Marcelo Eiras, Aricléia de Moraes Catarino |
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Přispěvatelé: | THOR VINICIUS MARTINS FAJARDO, CNPUV, OSMAR NICKEL, CNPUV. |
Jazyk: | portugalština |
Rok vydání: | 2015 |
Předmět: |
Levantamento
Espécies virais detection Nucleotide sequencing Biology Coat protein DNA sequencing proteína capsidial lcsh:Agriculture levantamento Plant virus survey Coat Proteins Vitis lcsh:Agriculture (General) Videira Gene Virus classification General Veterinary variabilidade variability detecção lcsh:S Virology lcsh:S1-972 Multiple infections Uva coat protein Animal Science and Zoology Agronomy and Crop Science |
Zdroj: | Ciência Rural v.45 n.3 2015 Ciência Rural Universidade Federal de Santa Maria (UFSM) instacron:UFSM Ciência Rural, Vol 45, Iss 3, Pp 379-385 (2015) Ciência Rural, Volume: 45, Issue: 3, Pages: 379-385, Published: MAR 2015 Repositório Institucional da EMBRAPA (Repository Open Access to Scientific Information from EMBRAPA-Alice) Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa) instacron:EMBRAPA |
Popis: | Os objetivos deste trabalho foram identificar as espécies virais presentes em vinhedos comerciais de duas regiões do Nordeste do Brasil e realizar a caracterização molecular parcial de isolados de três espécies virais. A diagnose foi realizada por meio de RT-PCR em tempo real para a detecção de Grapevine rupestris stem pitting-associated virus (GRSPaV), Grapevine virus A (GVA), Grapevine virus B (GVB), Grapevine leafroll-associated virus 2, 3 e 4 (GLRaV-2, -3 e -4), Grapevine fleck virus (GFkV), Grapevine rupestris vein feathering virus (GRVFV) e Grapevine fanleaf virus (GFLV). Exceto para GFLV, os vírus avaliados estão amplamente disseminados nas áreas amostradas, frequentemente em altas incidências e em infecções múltiplas, de até 98% e 76,4%, na Zona da Mata e no Vale do São Francisco, respectivamente. Isolados locais de GVA, GVB e GLRaV-3 foram parcialmente caracterizados com base na sequência completa de nucleotídeos do gene da proteína capsidial e apresentaram alta porcentagem de identidade de nucleotídeos com outros isolados brasileiros: 91,2% (GVA), 99,8% (GVB) e 99,7% (GLRaV-3) The objectives of this study were to identify viral species infecting commercial vineyards in two regions of Northeastern Brazil and perform partial molecular characterization of isolates of three virus species. The diagnosis was performed by real time RT-PCR for detection of GRSPaV, GVA, GVB, GLRaV-2, GLRaV-3, GLRaV-4, GFkV, GRVFV and GFLV. Except for GFLV, the evaluated viruses are widespread in the sampled areas, often in high incidences and in multiple infections, up to 98% and 76.4%, in the Zona da Mata and in the Vale do São Francisco regions, respectively. Local isolates of GVA, GVB and GLRaV-3, partially characterized by complete coat protein gene nucleotide sequencing, showed high percentage of nucleotide identities with other Brazilian isolates of these viruses: 91.2% (GVA), 99.8% (GVB) and 99.7% (GLRaV-3) |
Databáze: | OpenAIRE |
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