Türkiye'de Biberde Enfeksiyon Oluşturan Tobacco mild green mosaic virus İzolatlarının Belirlenmesi ve Moleküler Karakterizasyonu

Autor: Selin Ceren BALSAK, Seher Gül AVCU, Nihal BUZKAN
Jazyk: angličtina
Rok vydání: 2021
Předmět:
Zdroj: Volume: 25, Issue: Ek Sayı 2 490-496
Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi Tarım ve Doğa Dergisi
Journal Of Agriculture and Nature
ISSN: 2619-9149
Popis: In this study, Tobacco mild green mosaic virus (TMGMV) infection was investigated in pepper crops from two regions having high economical importance in Turkey. A total of 397 leaf and fruit samples showing mosaic, yellowing, mottling, and pitting symptoms were collected to test by double antibody sandwich ELISA (DAS-ELISA) using polyclonal antiserum. DAS-ELISA results indicated that 97 out of all tested samples (24.4%) were found to be infected with TMGMV. Samples resulting positive for TMGMV infection were used to amplify the virus coat protein (CP) gene sequences with specific primers by RT-PCR for further molecular characterization of the virus isolates. A comparison of the CP sequences of the virus isolates revealed that the identity of nucleotides ranged between 97.2 and 100%, and the amino acid similarity ranged between 96.8 and 100% among themselves. To the best of our knowledge, this is the first report of TMGMV infection in Capsicum annuum in Turkey.
Bu çalışmada, Türkiye’de biber yetiştiriciliğinin ekonomik olarak önemli olduğu iki bölgede Tobacco mild green mosaic virus (TMGMV) enfeksiyonu incelenmiştir. Mozaik, sararma, beneklenme ve çukurlaşma simptomu gösteren toplam 397 yaprak ve meyve örneği toplanmış ve double antibody sandwich ELISA (DAS-ELISA) ile poliklonal antiserum kullanılarak testlenmiştir. DAS-ELISA testinde testlenen örnekler içerisinde 97 örneğin (%24.4) TMGMV enfeksiyonuna sahip olduğu belirlenmiştir. TMGMV ile enfekteli pozitif örnekler, gen spesifik primerler kullanılarak RT-PCR yöntemiyle virüs kılıf protein (KP) geninin çoğaltılması ve izolatların moleküler karakterizasyonu için kullanılmıştır. KP nükleotid dizilerinin karşılaştırması sonucunda, izolatların kendi aralarında nükleotid benzerliğinin %97.2-100, amino asit benzerliğinin ise %96.8-100 arasında değiştiği belirlenmiştir. Bildiğimiz kadarıyla, bu Türkiye'de TMGMV’nin enfeksiyonunun Capsicum annuum'daki ilk raporudur.
Databáze: OpenAIRE
Externí odkaz: