Uso de genomas de SARS-CoV-2 para la estimación del número reproductivo efectivo (Rt) en Perú durante marzo y abril del 2020
| Autor: | Milagros Sánchez-Yupari, Pablo Tsukayama, Stephanie Montero, Pedro E. Romero |
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| Přispěvatelé: | Universidad Peruana Cayetano Heredia, Fondo Nacional de Desarrollo Científico y Tecnológico y de Innovación Tecnológica |
| Rok vydání: | 2021 |
| Předmět: |
Gynecology
Análisis Bayesiano Bases de Datos de Ácidos Nucleicos COVID-19 Epidemiología Molecular Filogenómica Genómica Modelos Epidemiológicos Perú SARS-CoV-2 Vigilancia medicine.medical_specialty 2019-20 coronavirus outbreak Coronavirus disease 2019 (COVID-19) Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) Public health Public Health Environmental and Occupational Health medicine General Medicine Biology |
| Zdroj: | Revista Peruana de Medicina Experimental y Salud Pública; 2021 Vol 38 (2); 267-71 Revistas Instituto Nacional de Salud Instituto Nacional de Salud instacron:INS |
| ISSN: | 1726-4642 1726-4634 |
| DOI: | 10.17843/rpmesp.2021.382.6417 |
| Popis: | The understanding of COVID-19, caused by the SARS-CoV-2, is essential to improve evidence-based public health policies. The effective reproductive number (Rt) in Peru was estimated using information from 113 complete genomes sequenced by the Instituto Nacional de Salud del Perú (INS), available in the GISAID public database. The Rt trend during March and April of 2020 was found to be similar to results from other epidemiological reports. The Rt decreased during the first two weeks of March. Its lowest value was reported during the week after the quarantine began. The Rt increased moderately after the second week of April. The implication of early decisions taken to mitigate the transmission are discussed. Genomic surveillance will be necessary to understand the transmission and evolution of SARS-CoV-2 in Peru, and will complement the epidemiological information. La comprensión de la enfermedad por coronavirus (COVID-19) provocada por el coronavirus de tipo 2 (SARS-CoV-2) causante de síndrome respiratorio agudo severo, utilizando un enfoque multidisciplinario, es esencial para mejorar la toma de decisiones basadas en evidencia. Se estimó el número reproductivo efectivo (Rt) en Perú a partir de 113 genomas completos generados por el Instituto Nacional de Salud (INS) del Perú almacenados en la base de datos pública GISAID. La tendencia mostrada por el Rt durante marzo y abril del 2020 fue similar a otras estimaciones epidemiológicas. El Rt disminuyó considerablemente durante la primera quincena de marzo, alcanzando su menor valor la semana posterior al inicio de la cuarentena, pero aumentó moderadamente desde la quincena de abril. Se discute las implicancias de las medidas tempranas tomadas para mitigar la transmisión. La vigilancia genómica será una herramienta necesaria para conocer la transmisión y evolución del virus, complementando la información epidemiológica. |
| Databáze: | OpenAIRE |
| Externí odkaz: |
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