Construction and assessment of a 3-T MRI brain template
| Autor: | Jean-Christophe Ferré, Pierre Jannin, Claire Haegelen, Omar El-Ganaoui, Florent Lalys |
|---|---|
| Přispěvatelé: | Vision, Action et Gestion d'informations en Santé (VisAGeS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE (IRISA-D5), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), CentraleSupélec-Télécom Bretagne-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-CentraleSupélec-Télécom Bretagne-Université de Rennes 1 (UR1), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA), Service de neurochirurgie [Rennes] = Neurosurgery [Rennes], CHU Pontchaillou [Rennes], Service de radiologie et imagerie médicale [Rennes] = Radiology [Rennes], Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Grosset, Aline |
| Jazyk: | angličtina |
| Rok vydání: | 2010 |
| Předmět: |
Male
MESH: Neuromuscular Diseases Computer science medicine.medical_treatment Deep Brain Stimulation MESH: Magnetic Resonance Angiography Brain Template MESH: Movement MESH: Sleep Apnea Syndromes 030218 nuclear medicine & medical imaging MESH: Magnetic Resonance Imaging Reduction (complexity) MESH: Basal Ganglia MESH: Positive-Pressure Respiration 0302 clinical medicine MESH: Child Image Processing Computer-Assisted Computer vision Mri brain MESH: Brain Mapping MESH: Middle Aged medicine.diagnostic_test Brain MESH: Cerebrovascular Circulation MESH: Follow-Up Studies Middle Aged Magnetic Resonance Imaging MESH: Image Processing Computer-Assisted MESH: Reproducibility of Results MESH: Nonlinear Dynamics medicine.anatomical_structure Neurology basal ganglia MESH: Evaluation Studies as Topic MESH: Acute Disease [SDV.IB]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering Algorithms Deep brain stimulation MESH: Depression Movement Cognitive Neuroscience MESH: Blood Gas Analysis Image processing MESH: Algorithms White matter 03 medical and health sciences MESH: Brain MESH: Hypoventilation MESH: Gyrus Cinguli MESH: Spin Labels medicine Humans MESH: Circadian Rhythm MESH: Intermittent Positive-Pressure Breathing Voxel size [SDV.IB] Life Sciences [q-bio]/Bioengineering MESH: Adolescent MESH: Humans 3T MRI business.industry MESH: Child Preschool Reproducibility of Results Magnetic resonance imaging MESH: Adult MESH: Retrospective Studies MESH: Vital Capacity MESH: Muscular Dystrophies Mr imaging MESH: Male Visualization Nonlinear Dynamics Artificial intelligence MESH: Deep Brain Stimulation business MESH: Female 030217 neurology & neurosurgery |
| Zdroj: | NeuroImage NeuroImage, Elsevier, 2010, 49 (1), pp.345-54. ⟨10.1016/j.neuroimage.2009.08.007⟩ NeuroImage, 2010, 49 (1), pp.345-54. ⟨10.1016/j.neuroimage.2009.08.007⟩ |
| ISSN: | 1053-8119 1095-9572 |
| DOI: | 10.1016/j.neuroimage.2009.08.007⟩ |
| Popis: | International audience; New MR imaging protocols enable visualization of brain structures. However, for dedicated clinical applications such as targeting deep brain stimulation (DBS), a more accurate localization requires the use of atlases. We developed a three-dimensional digitized mono-subject anatomical template of the human brain based on 3-T magnetic resonance images (MRI). By averaging 15 registered T1 image acquisitions, we have shown that the final image corresponds to an optimal image, limited by the performance of the 3-T MR machine. We compared different preprocessing workflows for template construction. With the optimal strategy, along with validated existing processing methods, one T1 template and one T1-T2 mixing template were created in order to improve visualization of spatially complex deep structures. Reduction of voxel size to 0.25 mm(3) was also advantageous to observe fine structures and white matter/gray matter intensity crossings. Results demonstrated that such a template also improved inter-patient registration for population comparison in DBS. These MR templates are made freely available to our community (http://www.vmip.org/mritemplate) to serve as a reference for neuroimage processing methods. |
| Databáze: | OpenAIRE |
| Externí odkaz: |
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