Genetic divergence in basil cultivars and hybrids
| Autor: | Rodrigo Pereira Alves, Arie Fitzgerald Blank, Tatiana S. Costa, Ana Veruska Cruz da Silva, Maria de Fátima Arrigoni-Blank, Camila Santos Almeida-Pereira, S.V. Alvares-Carvalho |
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| Jazyk: | angličtina |
| Rok vydání: | 2019 |
| Předmět: |
0106 biological sciences
dominant marker Soil Science Plant Science Horticulture Biology 01 natural sciences diversity SB1-1110 molecular characterization 03 medical and health sciences Genetic variation Cultivar Genetic variability 030304 developmental biology Hybrid 0303 health sciences Genetic diversity Plant culture Dna amplification Genetic divergence Genetic marker Ocimum basilicum 010606 plant biology & botany |
| Zdroj: | Horticultura Brasileira, Vol 37, Iss 2, Pp 180-187 (2019) Horticultura Brasileira v.37 n.2 2019 Horticultura Brasileira Associação Brasileira de Horticultura (ABH) instacron:ABH |
| ISSN: | 0102-0536 |
| Popis: | Basil is an aromatic herb that stands out fo its economic importance. It is consumed in natura and sed to obtain essential oil. The cultivation of this species in several regions of the world has allowed variations by natural crosses and euploidy, leading to the wide genetic variability found nowadays. Considering the importance of this species, we aimed to analyze the genetic diversity of 27 basil genotypes using ISSR molecular markers. Fourteen primers were employed for DNA amplification, resulting in 86% polymorphism. Based on the Jaccard?s dissimilarity index, the highest index (0.80) was observed between the individuals BAS001 and BAS012, while the lowest index (0.18) was detected between the genotypes BAS014 and BAS015. The genetic similarity among individuals was calculated, forming four distinct clusters. Most individuals (40.7%) were allocated in cluster I. The polymorphic information content (PIC) (0.89) indicated considerable levels of genetic diversity among genotypes. In this sense, the ISSR markers were efficient in the detection of polymorphisms between the accessions, suggesting the genetic variability of the collection. This result demonstrates the importance of the use of molecular markers and the advantages that this information provides to the breeding of the species. O manjericao e uma erva aromatica que se destaca por possuir importância economica. E consumido in natura e tambem utilizado na obtencao de oleo essencial. O cultivo desta especie em diversas regioes do mundo permitiu que surgissem variacoes mediante cru-zamentos naturais e euploidia, ocasionando a ampla variabilidade genetica existente. Considerando a importância desta especie, este trabalho teve como objetivo analisar a diversidade genetica de 27 genotipos de manjericao usando marcadores moleculares ISSR. Qua-torze primers foram utilizados para amplificacao do DNA, resultando em 86% de polimorfismo. Com base no indice de dissimilaridade de Jaccard, observou-se o maior indice (0,80) entre os individuos BAS001 e BAS012, enquanto que o menor indice de dissimilari-dade (0,18) foi detectado entre os genotipos BAS014 e BAS015. A semelhanca genetica entre individuos foi calculada, formando quatro grupos distintos. A maioria dos individuos (40,7%) foi agrupada no grupo I. O conteudo de informacao polimorfica (PIC) (0,89) indicou niveis consideraveis de diversidade genetica entre os genotipos. Neste sentido, os marcadores ISSR foram eficientes na deteccao de polimorfismos entre os acessos e confirmaram que e possivel inferir a variabilidade genetica na colecao. Isso demonstra a importância do uso de marcadores moleculares e as vantagens que esta informacao pode oferecer ao melhoramento genetico das especies. |
| Databáze: | OpenAIRE |
| Externí odkaz: |
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