Two novel Alphaflexiviridae members revealed by deep sequencing of the Vanilla (Orchidaceae) virome

Autor: Thierry Candresse, Anne Saison, Denis Filloux, Pierre-Yves Teycheney, Sandy Contreras, Charlotte Julian, Armelle Marais, Michel Grisoni, Chantal Faure, Sébastien Theil, Philippe Roumagnac
Přispěvatelé: Peuplements végétaux et bioagresseurs en milieu tropical (UMR PVBMT), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de La Réunion (UR), Biologie du fruit et pathologie (BFP), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1, Biologie et Génétique des Interactions Plante-Parasite (UMR BGPI), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro), LSV, Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES), Amélioration génétique et adaptation des plantes méditerranéennes et tropicales (UMR AGAP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad), Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2, Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)
Jazyk: angličtina
Rok vydání: 2017
Předmět:
Zdroj: Archives of Virology
Archives of Virology, Springer Verlag, 2017, Online First (12), ⟨10.1007/s00705-017-3540-9⟩
Archives of Virology, Springer Verlag, 2017, Online First, ⟨10.1007/s00705-017-3540-9⟩
ISSN: 0304-8608
1432-8798
DOI: 10.1007/s00705-017-3540-9⟩
Popis: UMR BFP - Equipe Virologie; The genomes of two novel viruses were assembled from 454 pyrosequencing data obtained from vanilla leaves from La Réunion. Based on genome organization and homologies, one agent was unambiguously classified as a member of the genus Potexvirus and named vanilla virus X (VVX). The second one, vanilla latent virus (VLV), is phylogenetically close to three unclassified members of the family Alphaflexiviridae with similarity to allexiviruses, and despite the presence of an additional 8-kDa open reading frame, we propose to include VLV as a new member of the genus Allexivirus. Both VVX and VLV were mechanically transmitted to vanilla plants, resulting in asymptomatic infections.
Databáze: OpenAIRE
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