The immune microenvironment of HPV-negative oral squamous cell carcinoma from never-smokers and never-drinkers patients suggests higher clinical benefit of IDO1 and PD1/PD-L1 blockade

Autor: Emilie Thomas, P. Zrounba, Marie-Cécile Michallet, N. Gadot, Sophie Deneuve, A. Colombe, Chloé Bertolus, Mojgan Devouassoux-Shisheboran, Pierre Saintigny, Jean-Philippe Foy, B Van den Eynde, Sandra Ortiz-Cuaran, Jérôme Fayette, J.-P. Michot, Patrick Goudot, Alain Puisieux, Alain Viari, Christophe Caux, Nathalie Bendriss-Vermare, C. Py, Marie-Alexandra Albaret, R. Incitti, Sylvie Lantuejoul
Přispěvatelé: Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon (UNICANCER/CRCL), Centre Léon Bérard [Lyon]-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Génétique et Physiopathologie des Tissus Musculaires (GPTM), Adaptation Biologique et Vieillissement = Biological Adaptation and Ageing (B2A), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut de Biologie Paris Seine (IBPS), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut de Biologie Paris Seine (IBPS), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Synergie Lyon Cancer-Platform of Bioinformatics-Gilles Thomas, Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre Léon Bérard [Lyon]-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Baobab, Département PEGASE [LBBE] (PEGASE), Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558 (LBBE), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558 (LBBE), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Equipe de recherche européenne en algorithmique et biologie formelle et expérimentale (ERABLE), Inria Grenoble - Rhône-Alpes, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria), Université Catholique de Louvain = Catholic University of Louvain (UCL), Laboratoire Central d'Anatomie et de Cytologie Pathologiques [Hôpital Edouard Herriot - HCL], Hôpital Edouard Herriot [CHU - HCL], Hospices Civils de Lyon (HCL)-Hospices Civils de Lyon (HCL), Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon (CRCL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre Léon Bérard [Lyon]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service de Stomatologie et Chirurgie Maxillo-facial [CHU Pitié-Salpêtrière], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-CHU Pitié-Salpêtrière [APHP], Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut de Biologie Paris Seine (IBPS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut de Biologie Paris Seine (IBPS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre Léon Bérard [Lyon]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université Catholique de Louvain (UCL), Sagot, Marie-France, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut de Biologie Paris Seine (IBPS), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)
Jazyk: angličtina
Rok vydání: 2017
Předmět:
Zdroj: Annals of Oncology
Annals of Oncology, 2017, 28 (8), pp.1934-1941. ⟨10.1093/annonc/mdx210⟩
Annals of Oncology, Oxford University Press (OUP), 2017, 28 (8), pp.1934-1941. ⟨10.1093/annonc/mdx210⟩
Annals of Oncology, Elsevier, 2017, 28 (8), pp.1934-1941. ⟨10.1093/annonc/mdx210⟩
ISSN: 0923-7534
1569-8041
DOI: 10.1093/annonc/mdx210⟩
Popis: Background Never-smokers and never-drinkers patients (NSND) suffering from oral squamous cell carcinoma (OSCC) are epidemiologically different from smokers drinkers (SD). We therefore hypothesized that they harbored distinct targetable molecular alterations. Patients and methods Data from The Cancer Genome Atlas (TCGA) (discovery set), Gene Expression Omnibus and Centre Léon Bérard (CLB) (three validation sets) with available gene expression profiles of HPV-negative OSCC from NSND and SD were mined. Protein expression profiles and genomic alterations were also analyzed from TCGA, and a functional pathway enrichment analysis was carried out. Formalin-fixed paraffin-embedded samples from 44 OSCC including 20 NSND and 24 SD treated at CLB were retrospectively collected to perform targeted-sequencing of 2559 transcripts (HTG EdgeSeq system), and CD3, CD4, CD8, IDO1, and PD-L1 expression analyses by immunohistochemistry (IHC). Enrichment of a six-gene interferon-c signature of clinical response to pembrozulimab (PD-1 inhibitor) was evaluated in each sample from all cohorts, using the single sample gene set enrichment analysis method. Results A total of 854 genes and 29 proteins were found to be differentially expressed between NSND and SD in TCGA. Functional pathway analysis highlighted an overall enrichment for immune-related pathways in OSCC from NSND, especially involving T-cell activation. Interferon-c response and PD1 signaling were strongly enriched in NSND. IDO1 and PD-L1 were overexpressed and the score of response to pembrolizumab was higher in NSND than in SD, although the mutational load was lower in NSND. IHC analyses in the CLB cohort evidenced IDO1 and PD-L1 overexpression in tumor cells that was associated with a higher rate of tumor-infiltrating T-cells in NSND compared with SD. Conclusion The main biological and actionable difference between OSCC from NSND and SD lies in the immune microenvironment, suggesting a higher clinical benefit of PD-L1 and IDO1 inhibition in OSCC from NSND.
Databáze: OpenAIRE
Externí odkaz: