Genomic resources and databases
| Autor: | François Sabot, Nordine El Hassouni, Pierre Larmande, Bertrand Pitollat, Guilhem Sempere, Anestis Gkanogiannis, Christine Tranchant-Dubreuil, Cédric Farcy, Enrique Ortega, Cécile Monat, Stéphanie Pointet, Dominique This, Marilyne Summo, Frédéric De Lamotte, Delphine Larivière, David Couvin, Chantal Hamelin, Sébastien Ravel, Ndomassi Tando, Manuel Ruiz, Gaëtan Droc, Stéphanie Bocs, Jean-François Dufayard, Alexis Dereeper, Sarah Gautier, Mathieu Rouard, Yann Hueber, Valentin Guignon, Guillaume Martin |
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| Přispěvatelé: | Bioversity International [Montpellier], Bioversity International [Rome], Consultative Group on International Agricultural Research [CGIAR] (CGIAR)-Consultative Group on International Agricultural Research [CGIAR] (CGIAR), Biodiversity International, Amélioration génétique et adaptation des plantes méditerranéennes et tropicales (UMR AGAP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad), Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Biologie et Génétique des Interactions Plante-Parasite (UMR BGPI), Diversité, adaptation, développement des plantes (UMR DIADE), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud]), Interactions hôtes-vecteurs-parasites-environnement dans les maladies tropicales négligées dues aux trypanosomatides (UMR INTERTRYP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université de Bordeaux (UB), UMR - Interactions Plantes Microorganismes Environnement (UMR IPME), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Université de Montpellier (UM)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud]), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Université de Montpellier (UM)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad), Naithani, S. (ed.), Van de Peer, Y. (ed.) |
| Jazyk: | angličtina |
| Rok vydání: | 2016 |
| Předmět: |
0106 biological sciences
0301 basic medicine Mediterranean climate [SDV.SA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences Manihot esculenta Coffea Plant Science 01 natural sciences Biochemistry F30 - Génétique et amélioration des plantes Agricultural science interface d'application crop databases genomics galaxy next Generation Sequencing pipeline sequence variants workflow Vitis vinifera base de données Saccharum officinarum biology U10 - Informatique mathématiques et statistiques Agricultural sciences interface informatique Geography C30 - Documentation et information Système d'information Information Retrieval Bio-informatique Banque de données Zone tropicale Resource (biology) Bioinformatics plante méditerranéenne Oryza sativa Genomics génomique Crop 03 medical and health sciences Ressource génétique végétale Bioinformatique Genetics Theobroma cacao donnée génomique Cocos nucifera plante tropicale Recherche d'information Musa Cell Biology biology.organism_classification Amélioration des plantes 030104 developmental biology Gène [INFO.INFO-IR]Computer Science [cs]/Information Retrieval [cs.IR] ZONE MEDITERRANEENNE Plante de culture [INFO.INFO-BI]Computer Science [cs]/Bioinformatics [q-bio.QM] Ressource végétale Sciences agricoles 010606 plant biology & botany Developmental Biology |
| Zdroj: | Current Plant Biology Current Plant Biology, 2016, 7-8, pp.6-9. ⟨10.1016/j.cpb.2016.12.002⟩ Current Plant Biology, Elsevier, 2016, 7-8, pp.6-9. ⟨10.1016/j.cpb.2016.12.002⟩ Current Plant Biology (7-8), 6-9. (2016) |
| ISSN: | 2214-6628 |
| DOI: | 10.1016/j.cpb.2016.12.002⟩ |
| Popis: | International audience; The South Green Web portal (http://www.southgreen.fr/http://www.southgreen.fr/) provides access to a large panel of public databases, analytical workflows and bioinformatics resources dedicated to the genomics of tropical and Mediterranean crops. The portal contains currently about 20 information systems and tools and targets a broad range of crops such as Banana, Cacao, Cassava, Coconut, Coffee, Grape, Rice and Sugarcane. |
| Databáze: | OpenAIRE |
| Externí odkaz: |
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