Functional metagenomics: construction and high-throughput screening of fosmid libraries for discovery of novel carbohydrate-active enzymes
| Autor: | Davide A. Cecchini, Sandrine Demanèche, Sandra Pizzut-Serin, Samuel Jacquiod, Elisabeth Laville, Gabrielle Veronese, Laure Franqueville, Pascal Simonet, Sophie Bozonnet, Lisa Ufarté |
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| Přispěvatelé: | Laboratoire d'Ingénierie des Systèmes Biologiques et des Procédés (LISBP), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Ampère, Département Bioingénierie (BioIng), Ampère, École Centrale de Lyon (ECL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École Centrale de Lyon (ECL), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), MESR, Large Project Metascreen (Metaprogramme MEM), Ampère (AMPERE), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-École Centrale de Lyon (ECL), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Francis Martin, Stéphane Uroz, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) |
| Jazyk: | angličtina |
| Rok vydání: | 2016 |
| Předmět: |
0301 basic medicine
[SDV.OT]Life Sciences [q-bio]/Other [q-bio.OT] Complex glycans Metagenomic dna High-throughput screening Computational biology Biology Metagenomic DNA Microbiology Fosmid 03 medical and health sciences 030104 developmental biology Metagenomics High-Throughput Screening Assays Fosmidic libraries Carbohydrate-active enzymes Carbohydrate active enzymes |
| Zdroj: | Microbial Environmental Genomics MEG Microbial Environmental Genomics MEG, 1399, Springer, 321 p., 2016, Methods in Molecular Biology, 978-1-4939-3367-9. ⟨10.1007/978-1-4939-3369-3_15⟩ Microbial Environmental Genomics (MEG) ISBN: 9781493933679 Microbial Environmental Genomics MEG, 1399 (1ère ed.), Springer, 321 p., 2016, Methods in Molecular Biology, 978-1-4939-3367-9. ⟨10.1007/978-1-4939-3369-3_15⟩ |
| DOI: | 10.1007/978-1-4939-3369-3_15⟩ |
| Popis: | Activity-based metagenomics is one of the most efficient approaches to boost the discovery of novel biocatalysts from the huge reservoir of uncultivated bacteria. In this chapter, we describe a highly generic procedure of metagenomic library construction and high-throughput screening for carbohydrate-active enzymes. Applicable to any bacterial ecosystem, it enables the swift identification of functional enzymes that are highly efficient, alone or acting in synergy, to break down polysaccharides and oligosaccharides. |
| Databáze: | OpenAIRE |
| Externí odkaz: |
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