Mesorhizobium intechi sp. nov. isolated from nodules of Lotus tenuis in soils of the Flooding Pampa, Argentina
| Autor: | Liz Marjory Stefanny Cumpa Velásquez, Luis Aníbal Diambra, Mariano Pistorio, Lars Hestbjerg Hansen, María Florencia Fontana, Maria Julia Estrella, Analía Inés Sannazzaro, Gonzalo Arturo Torres Tejerizo |
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| Jazyk: | angličtina |
| Rok vydání: | 2020 |
| Předmět: |
DNA
Bacterial Root nodule Sequence analysis PHYLOGENY Argentina Applied Microbiology and Biotechnology Microbiology Rhizobia Ciencias Biológicas 03 medical and health sciences Biología Celular Microbiología Genus RNA Ribosomal 16S Botany LOTUS TENUIS MESORHIZOBIUM SP. NOV Ecology Evolution Behavior and Systematics Phylogeny Soil Microbiology 030304 developmental biology 0303 health sciences Genes Essential biology Phylogenetic tree 030306 microbiology Fatty Acids RHIZOBIA Mesorhizobium Nucleic Acid Hybridization Sequence Analysis DNA 16S ribosomal RNA biology.organism_classification Genes Bacterial Lotus Lotus tenuis Root Nodules Plant Genome Bacterial CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS |
| Popis: | Three symbiotic nitrogen-fixing bacteria (BD68T, BD66 and BD73) isolated from root nodules of Lotus tenuis in lowland soils of the Flooding Pampa (Argentina), previously classified as members of the Mesorhizobium genus, were characterized in this study. Phylogenetic analysis of their 16S rRNA gene sequences showed a close relationship to M. japonicum MAFF 303099T, M. erdmanii USDA 3471T, M. carmichaelinearum ICMP 18942T, M. opportunistum WSM 2975T and M. jarvisii ATCC 33699T, with sequence identities of 99.72%?100%. Multilocus sequence analysis of other housekeeping genes revealed that the three isolates belonged to a phylogenetically distinct clade within the genus Mesorhizobium. Strain BD68T was designated as the group representative and its genome was fully sequenced. The average nucleotide identity and in silico DNA-DNA hybridization comparisons between BD68T and the most related type strains showed values below the accepted threshold for species discrimination. Phenotypic and chemotaxonomic features were also studied. Based on these results, BD68T, BD66 and BD73 could be considered to represent a novel species of the genus Mesorhizobium, for which the name Mesorhizobium intechi sp. nov. is hereby proposed. The type strain of this species is BD68T (=CECT 9304T = LMG 30179T). Fil: Estrella, Maria Julia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Investigaciones Biotecnológicas. Instituto de Investigaciones Biotecnológicas "Dr. Raúl Alfonsín" (sede Chascomús). Universidad Nacional de San Martín. Instituto de Investigaciones Biotecnológicas. Instituto de Investigaciones Biotecnológicas "Dr. Raúl Alfonsín" (sede Chascomús); Argentina Fil: Fontana, María Florencia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Investigaciones Biotecnológicas. Instituto de Investigaciones Biotecnológicas "Dr. Raúl Alfonsín" (sede Chascomús). Universidad Nacional de San Martín. Instituto de Investigaciones Biotecnológicas. Instituto de Investigaciones Biotecnológicas "Dr. Raúl Alfonsín" (sede Chascomús); Argentina Fil: Cumpa Velásquez, Liz Marjory Stefanny. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Investigaciones Biotecnológicas. Instituto de Investigaciones Biotecnológicas "Dr. Raúl Alfonsín" (sede Chascomús). Universidad Nacional de San Martín. Instituto de Investigaciones Biotecnológicas. Instituto de Investigaciones Biotecnológicas "Dr. Raúl Alfonsín" (sede Chascomús); Argentina Fil: Torres Tejerizo, Gonzalo Arturo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Biotecnología y Biología Molecular. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Instituto de Biotecnología y Biología Molecular; Argentina Fil: Diambra, Luis Anibal. Universidad Nacional de La Plata. Centro Regional de Estudios Genómicos; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata; Argentina Fil: Hansen, Lars Hestbjerg. Universidad de Copenhagen; Dinamarca Fil: Pistorio, Mariano. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Biotecnología y Biología Molecular. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Instituto de Biotecnología y Biología Molecular; Argentina Fil: Sannazzaro, Analía Inés. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Investigaciones Biotecnológicas. Instituto de Investigaciones Biotecnológicas "Dr. Raúl Alfonsín" (sede Chascomús). Universidad Nacional de San Martín. Instituto de Investigaciones Biotecnológicas. Instituto de Investigaciones Biotecnológicas "Dr. Raúl Alfonsín" (sede Chascomús); Argentina |
| Databáze: | OpenAIRE |
| Externí odkaz: |
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