Genomic Instability in Somatic Hybridization between Poncirus and Citrus Species Aiming to Create New Rootstocks
| Autor: | Dominique Dambier, Pascal Barantin, Gabriel Boulard, Gilles Costantino, Pierre Mournet, Aude Perdereau, Raphaël Morillon, Patrick Ollitrault |
|---|---|
| Přispěvatelé: | Département Systèmes Biologiques (Cirad-BIOS), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad), Amélioration génétique et adaptation des plantes méditerranéennes et tropicales (UMR AGAP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro Montpellier, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Université de Montpellier (UM), Genoscope - Centre national de séquençage [Evry] (GENOSCOPE), Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Amélioration Génétique et Adaptation des Plantes méditerranéennes et Tropicales Corse - Antenne Corse (AGAP-Corse), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), ANR-10-INBS-0009,France-Génomique,Organisation et montée en puissance d'une Infrastructure Nationale de Génomique(2010), European Project: LIFE18 CCA/ES/001109,LIFE Vida for Citrus |
| Jazyk: | angličtina |
| Rok vydání: | 2022 |
| Předmět: |
H01 - Protection des végétaux - Considérations générales
Citrus Stress abiotique citrumelo Plant Science protoplast fusion somatic embryogenesis genotyping by sequencing somaclonal variation Citrus sinensis Citrus reticulata Poncirus trifoliata citrange citrandarin F30 - Génétique et amélioration des plantes génomique Résistance aux facteurs nuisibles Hybridation somatique Résistance physiologique au stress Porte greffe [SDV.GEN]Life Sciences [q-bio]/Genetics food and beverages Amélioration des plantes Stress biotique Agronomy and Crop Science Food Science |
| Zdroj: | Agriculture Agriculture, 2022, 12 (2), ⟨10.3390/agriculture12020134⟩ Agriculture (Basel) Agriculture; Volume 12; Issue 2; Pages: 134 |
| ISSN: | 2077-0472 |
| Popis: | International audience; Rootstocks are an important component for citrus adaptation to increasing biotic and abiotic stresses resulting from global climate change. There is a strong complementarity between Citrus species, which adapt to abiotic stresses, and Poncirus trifoliata and its intergeneric hybrids, which exhibit resistances or tolerances to major diseases and pests. Thus, symmetrical somatic hybridization between complementary diploid rootstocks of these two genera appears to be an efficient way to develop new tetraploid rootstocks in order to address the new challenges of the citrus industry. New intergeneric somatic hybrids were obtained by electrofusion between protoplasts of Citrus and P. trifoliata hybrids. Extensive characterization of the nuclear and cytoplasmic genomes was performed by genotyping-by-sequencing (GBS) analysis. This revealed diploid cybrids and nuclear somatic hybrids. Mitochondrial genomes were mostly inherited from the callus parent, but homologous recombination events were observed for one parental combination. Chloroplasts exhibited random uniparental inheritance. GBS revealed local chromosomal instabilities for all nuclear somatic hybrids and whole chromosome eliminations for two hybrids. However, at the whole genome level, symmetrical addition of the nuclear genomes of both parents was predominant and all somatic hybrids displayed at least one trifoliate orange haplotype throughout the genome. |
| Databáze: | OpenAIRE |
| Externí odkaz: |
|