GENETIC POLYMORPHISM OF STAPHYLOCOCCUS EPIDERMIDIS STRAINS IN PATIENTS OF THE NEONATAL INTENSIVE CARE UNIT
| Autor: | I. S. Mukosey, O. V. Ionov, A B Gordeev, L A Lyubasovskaya, V V Zubkov, D V Dubodelov, Dmitry Yu. Trofimov, T. V. Priputnevich, T. O. Kochetkova, J V Rodchenko, I.V. Nikitina |
|---|---|
| Jazyk: | ruština |
| Rok vydání: | 2017 |
| Předmět: |
Neonatal intensive care unit
biology business.industry Staphylococcus epidermidis POLYMORPHISM NGS VIRULENCE RESISTANCE STAPHYLOCOCCUS EPIDERMIDIS NEONATES SEQUENCE TYPE polymorphism NGS virulence resistance Staphylococcus epidermidis neonates sequence type Medicine Virulence In patient General Medicine business biology.organism_classification Microbiology |
| Zdroj: | Вестник Российского государственного медицинского университета. |
| ISSN: | 2070-7320 |
| Popis: | Staphylococcus epidermidis is a member of the normal bacterial flora of humans capable of causing potentially dangerous diseases in neonates with very or extremely low birth weight. The number of genes responsible for virulence and antibiotic resistance may vary in different S. epidermidis strains. We sequenced isolates of S. epidermidis to explore genetic diversity of 14 strains circulating in the Neonatal Intensive Care Unit of Kulakov Research Center for Obstetrics, Gynecology and Perinatology. Among the studied strains, 8 sequence types were identified, the most frequent being ST2 and ST59, both of which belong to the clonal complex CC2. Of 14 studied strains, 10 were of CC2 type. The studied strains revealed a variety of genes responsible for antibiotic resistance. We found 15 genes that provided resistance to aminoglycosides, beta-lactam antibiotics, fusidic acid, macrolides, lincosamides, streptogramin B, tetracycline, and trimethoprim. We identified a number of genes associated with virulence (aae, atlE, aap, embp), whose frequency in the studied isolates was varied. The insertion element IS256 was detected in 9 strains, and 7 strains revealed the presence of the ica-operon responsible for the biosynthesis of the biofilm matrix proteins. Staphylococcus epidermidis — представитель нормальной микрофлоры человека, способный вызывать опасные заболевания у новорожденных с очень низкой и экстремально низкой массой тела при рождении. Различные штаммы S. epidermidis обладают разным спектром генов, ассоциированных с их резистентностью к антимикробным препаратам и патогенностью. По результатам анализа данных полных геномных секвенирований четырнадцати штаммов S. epidermidis изучено генетическое разнообразие штаммов, циркулирующих в отделении реанимации и интенсивной терапии новорожденных НЦАГиП им. В. И. Кулакова. Выявлена принадлежность штаммов к восьми сиквенс-типам, из которых чаще встречались ST2 и ST59, принадлежащие к единому клональному комплексу СС2. К данному клональному комплексу относились 10 из 14 штаммов. Показано, что изученные штаммы обладали широким спектром генов резистентности к антимикробным препаратам. Обнаружено 15 различных генов, обуславливающих резистентность штаммов к аминогликозидам, бета-лактамным антибиотикам, фузидиевой кислоте, макролидам, линкозамидам, стрептограмину B, тетрациклину и триметоприму. Выявлены гены, ассоциированные с патогенностью (aae, atlE, aap, embp), встречающиеся в геномах изученных штаммов с разной частотой. В геномах девяти штаммов был обнаружен инсерционный элемент IS256, а в геномах семи штаммов — гены ica-оперона, отвечающего за синтез белков матрикса биопленок. |
| Databáze: | OpenAIRE |
| Externí odkaz: |
|