Loss of Dicer in Sertoli cells has a major impact on the testicular proteome of mice

Autor: Charles E. Vejnar, Marguerite Neerman-Arbez, Charles Pineau, Antoine Rolland, Olivier Schaad, Serge Nef, Marilena D. Papaioannou, Florian Guillou, Alexandre Fort, Mélanie Lagarrigue, Patrick Descombes, Evgeny M. Zdobnov, Florence Aubry, Françoise Kühne
Přispěvatelé: Department of Genetic Medicine and Development [Geneva], Université de Genève (UNIGE), Virus, Environnement et Reproduction, Groupe d'Etude de la Reproduction Chez l'Homme et les Mammiferes (GERHM), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-IFR140-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-IFR140-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Swiss Institute of Bioinformatics (SIB), Swiss Institute of Bioinformatics-Swiss Institute of Bioinformatics, Swiss Institute of Bioinformatics (SIB), Swiss Institute of Bioinformatics, Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-IFR140-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Station commune de Recherches en Ichtyophysiologie, Biodiversité et Environnement (SCRIBE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-IFR140-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-IFR140-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Genomics Platform, University of Geneva [Switzerland]-National Center of Competence in Research ‘Frontiers in Genetics', Physiologie de la reproduction et des comportements [Nouzilly] (PRC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Tours-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Swiss Institute of Bioinformatics [Lausanne] (SIB), Université de Lausanne (UNIL)-Université de Lausanne (UNIL), Swiss Institute of Bioinformatics [Lausanne] (SIB), Université de Lausanne (UNIL), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Station commune de Recherches en Ichtyophysiologie, Biodiversité et Environnement (SCRIBE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Swiss Institute of Bioinformatics [Lausanne] (SIB), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Station commune de Recherches en Ichtyophysiologie, Biodiversité et Environnement (SCRIBE), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Genève = University of Geneva (UNIGE), Université de Rennes (UR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Rennes (UR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Swiss Institute of Bioinformatics [Lausanne] (SIB), Université de Lausanne = University of Lausanne (UNIL)-Université de Lausanne = University of Lausanne (UNIL), Université de Lausanne = University of Lausanne (UNIL), Université de Rennes (UR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Rennes (UR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Station commune de Recherches en Ichtyophysiologie, Biodiversité et Environnement (SCRIBE), Université de Rennes (UR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Rennes (UR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Genève = University of Geneva (UNIGE)-National Center of Competence in Research ‘Frontiers in Genetics', Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur] (IFCE)-Université de Tours (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Rennes (UR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Jazyk: angličtina
Rok vydání: 2011
Předmět:
Superoxide Dismutase/genetics/metabolism
Enzymologic
Ribonuclease III
Male
Transcription
Genetic
Proteome
Ribonuclease III/deficiency/genetics
Proteome/metabolism
Inbred C57BL
Biochemistry
Transgenic
Analytical Chemistry
Mice
Superoxide Dismutase-1
MESH: Ribonuclease III
Genes
Reporter
Luciferases
Firefly
RNA interference
Tandem Mass Spectrometry
Testis
MESH: Up-Regulation
ddc:576.5
MESH: Animals
Promoter Regions
Genetic
Luciferases
Luciferases
Firefly/biosynthesis/genetics
3' Untranslated Regions
MESH: Superoxide Dismutase
Sequence Deletion
Regulation of gene expression
0303 health sciences
MESH: Testis
MESH: Gene Expression Regulation
Enzymologic
Testis/metabolism/pathology
030302 biochemistry & molecular biology
MESH: 3' Untranslated Regions
MESH: Sequence Deletion
Sertoli cell
Up-Regulation
MESH: Proteome
medicine.anatomical_structure
RNA Interference
Transcription
Germ cell
MESH: Mice
Transgenic
MESH: RNA Interference
Mice
Transgenic
Biology
Gene Expression Regulation
Enzymologic
Promoter Regions
MicroRNAs/genetics/metabolism
03 medical and health sciences
MESH: Gene Expression Profiling
Genetic
MESH: Sertoli Cells
MESH: Mice
Inbred C57BL
microRNA
MESH: Promoter Regions
Genetic
medicine
Animals
[SDV.BBM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry
Molecular Biology
Molecular Biology
Firefly
Reporter
MESH: Mice
030304 developmental biology
Sertoli Cells
MESH: Luciferases
Firefly
Superoxide Dismutase
Research
Gene Expression Profiling
MESH: Transcription
Genetic
MESH: Genes
Reporter
MESH: Tandem Mass Spectrometry
Molecular biology
MESH: Male
Mice
Inbred C57BL
MicroRNAs
Gene Expression Regulation
Genes
biology.protein
Sertoli Cells/metabolism
Spermatogenesis
MESH: MicroRNAs
Dicer
Zdroj: Molecular and Cellular Proteomics
Molecular and Cellular Proteomics, American Society for Biochemistry and Molecular Biology, 2011, 10 (4), pp.M900587MCP200. ⟨10.1074/mcp.M900587-MCP200⟩
Molecular & cellular proteomics : MCP
Molecular and Cellular Proteomics, 2011, 10 (4), pp.M900587MCP200. ⟨10.1074/mcp.M900587-MCP200⟩
Molecular and Cellular Proteomics, Vol. 10, No 4 (2011) P. M900587MCP200
ISSN: 1535-9476
1535-9484
Popis: International audience; Sertoli cells (SCs) are the central, essential coordinators of spermatogenesis, without which germ cell development cannot occur. We previously showed that Dicer, an RNaseIII endonuclease required for microRNA (miRNA) biogenesis, is absolutely essential for Sertoli cells to mature, survive, and ultimately sustain germ cell development. Here, using isotope-coded protein labeling, a technique for protein relative quantification by mass spectrometry, we investigated the impact of Sertoli cell-Dicer and subsequent miRNA loss on the testicular proteome. We found that, a large proportion of proteins (50 out of 130) are up-regulated by more that 1.3-fold in testes lacking Sertoli cell-Dicer, yet that this protein up-regulation is mild, never exceeding a 2-fold change, and is not preceeded by alterations of the corresponding mRNAs. Of note, the expression levels of six proteins of interest were further validated using the Absolute Quantification (AQUA) peptide technology. Furthermore, through 3'UTR luciferase assays we identified one up-regulated protein, SOD-1, a Cu/Zn superoxide dismutase whose overexpression has been linked to enhanced cell death through apoptosis, as a likely direct target of three Sertoli cell-expressed miRNAs, miR-125a-3p, miR-872 and miR-24. Altogether, our study, which is one of the few in vivo analyses of miRNA effects on protein output, suggests that, at least in our system, miRNAs play a significant role in translation control.
Databáze: OpenAIRE
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