РАЗРАБОТКА HALOPLEX ПАНЕЛИ И ПОДГОТОВКА ДНК-БИБЛИОТЕК ДЛЯ ТАРГЕТНОГО СЕКВЕНИРОВАНИЯ СЕРДЕЧНЫХ АРИТМИЙ
| Autor: | PANZITT K., TRAJANOSKI S., GUELLY C. |
|---|---|
| Jazyk: | ruština |
| Rok vydání: | 2016 |
| Předmět: |
таргетті секвенирлеу
HALOPLEX КАРДИОГЕНЕТИЧЕСКАЯ ПАНЕЛЬ ТАРГЕТНОЕ СЕКВЕНИРОВАНИЕ СЕРДЕЧНЫЕ АРИТМИИ ALOPLEX CARDIOGENETIC PANEL TARGETED SEQUENCING CARDIAC ARRHYTHMIAS HALOPLEX КАРДИОГЕНЕТИКАЛЫқ ПАНЕЛі ТАРГЕТТі СЕКВЕНИРЛЕУ ЖүРЕК АРИТМИЯЛАРЫ cardiac arrhythmias жүрек аритмиялары HaloPlex кардиогенетическая панель сердечные аритмии HaloPlex cardiogenetic panel targeted sequencing таргетное секвенирование HaloPlex кардиогенетикалық панелі |
| DOI: | 10.34689/sh.2016.18.5.003 |
| Popis: | В данной статье подробно описана методика создания пользовательской HaloPlex кардиогенетической панели (Agilent Technologies) и метод подготовки ДНК-библиотек для таргетного секвенирования 96 генов ассоциированных с сердечными аритмиями. Онлайн программа SureDesign Online Design software (Agilent Technologies) была использована для создания HaloPlex кардиогенетической панели. Финальный дизайн панели был создан для платформы Illumina c помощью Human Genome version 19, GRCh 37. Программой было разработано 19958 ампликонов, 99,46% всех таргетных регионов были покрыты удачно. С использованием данной кардиогенетической панели были подготовлены ДНК-библиотеки для 48 образцов. Method of preparation of custom HaloPlex cardiogenetic panel (Agilent Technologies) and method of preparation of DNA libraries for targeted sequencing of 96 genes associated with cardiac arrhythmias were described in details in this article. SureDesign Online Design software (Agilent Technologies) was used to create the HaloPlex panel. Final design was developed for Illumina platform using Human Genome version 19, GRCh 37. 19958 amplicons were generated by the program, 99,46% of all target regions were covered successfully. DNA libraries were prepared for 48 samples using the custom HaloPlex cardiogenetic panel. Мақалада жүрек аритмияларымен ассоциацияланған 96 генді таргетті секвенирлеуге арналған HaloPlex пайдаланушы кардиогенетикалық панелін (Agilent Technologies) әзірлеу әдістемесі және ДНҚ-кітапханаларын дайындау әдісі толықтай сипатталған. HaloPlex кардиогенетикалықпанелін дайындауда SureDesign Online Design software (Agilent Technologies) онлайн бағдарламасы қолданылды. Панель дизайні Human Genome version 19, GRCh 37 көмегіменIllumina платформасына арнап дайындалды. Бағдарламамен 19958 ампликон әзірленді, барлық таргетті аймақтардың 99,46% сәтті үлестірілді. Аталған кардиогенетикалық панель көмегімен 48 үлгіге ДНҚ-кітапханалары дайындалды. Наука и здравоохранение, Выпуск 5 (18) 2016 |
| Databáze: | OpenAIRE |
| Externí odkaz: |
|