DNA barcoding and molecular systematics of the benthic and demersal organisms of the CEAMARC survey
Autor: | Catherine Ozouf-Costaz, Piotr Kuklinski, Claudia P. Arango, Benjamin Pierrat, Arnaud Couloux, Lenaïg G. Hemery, Anne Chenuil, Dirk Steinke, Cyril Gallut, Guillaume Lecointre, Christopher L. Mah, Nicolas Puillandre, Huw J. Griffiths, Katarzyna Tarnowska, Bruno David, Françoise Denis, Nadia Améziane, Pierre Lozouet, Rachel A. Grant, Sarah J. Adamowizc, Elie Poulin, Agnès Dettai, Katrin Linse, Claire Piedallu, David K. A. Barnes, Angie Díaz, Thomas Saucède, Timothy D. O'Hara, Marc Eléaume, Aurélie Froger, Jan M. Strugnell, Corinne Cruaud, Victoria Wadley, Françoise Monniot, Louise Allcock, Jean-Pierre Féral, Darren W. Stevens, Peter J. Smith, Iain Barratt, Christoph D. Schubart, Mark D. Norman, Graham W. Hosie, Martin J. Riddle, Sarah Samadi, Gaël P.J. Denys, Christoph Held |
---|---|
Přispěvatelé: | Systématique, adaptation, évolution ( SAE ), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Canadian Centre for DNA Barcoding, University of Guelph, Martin Ryan Marine Science Institute, National University of Ireland [Galway] ( NUI Galway ), School of Biological Sciences, Queen's University [Belfast] ( QUB ), Natural Environments Program, Queensland Museum, British Antarctic Survey ( BAS ), Natural Environment Research Council ( NERC ), Diversité, évolution et écologie fonctionnelle marine ( DIMAR ), Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Genoscope - Centre national de séquençage [Evry] ( GENOSCOPE ), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ), Biogéosciences [Dijon] ( BGS ), Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Le Mans Université ( UM ), Biologie des Organismes et Ecosystèmes Aquatiques ( BOREA ), Université des Antilles ( UA ) -Université de Caen Normandie ( UNICAEN ), Normandie Université ( NU ) -Normandie Université ( NU ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Muséum National d'Histoire Naturelle ( MNHN ) -Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Instituto de Ecología y Biodiversidad, Universidad de Santiago de Chile [Santiago] ( USACH ), Biologie des organismes marins et écosystèmes ( BOME ), Scott Polar Research Institute, University of Cambridge [UK] ( CAM ), Functional Ecology, Alfred Wegener Institute, Helmholtz Centre for Polar and Marine Research ( AWI ), Department of Sustainability, Environment, Water, Population and Communities, Australian Antarctic Division, Natural History Museum, Institute of Oceanology, Polska Akademia Nauk ( PAN ), Department of Invertebrate Zoology, Smithsonian Institution-National Museum of Natural History, Museum Victoria, Museum Victoria [Melbourne], Biologie 1, Universität Regensburg ( UR ), National Institute of Water and Atmospheric Research [Wellington] ( NIWA ), Department of Zoology, Systématique, adaptation, évolution (SAE), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), National University of Ireland [Galway] (NUI Galway), Queen's University [Belfast] (QUB), British Antarctic Survey (BAS), Natural Environment Research Council (NERC), Diversité, évolution et écologie fonctionnelle marine (DIMAR), Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Genoscope - Centre national de séquençage [Evry] (GENOSCOPE), Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Biogéosciences [UMR 6282] (BGS), Université de Bourgogne (UB)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Le Mans Université (UM), Biologie des Organismes et Ecosystèmes Aquatiques (BOREA), Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université des Antilles (UA), Biologie des organismes marins et écosystèmes (BOME), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), University of Cambridge [UK] (CAM), Alfred-Wegener-Institut, Helmholtz-Zentrum für Polar- und Meeresforschung (AWI), Australian Antarctic Division (AAD), Australian Government, Department of the Environment and Energy, The Natural History Museum [London] (NHM), Polska Akademia Nauk = Polish Academy of Sciences (PAN), Universität Regensburg (UR), National Institute of Water and Atmospheric Research [Wellington] (NIWA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2, Biogéosciences [UMR 6282] [Dijon] (BGS), Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université des Antilles (UA)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Sorbonne Université (SU)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN) |
Jazyk: | angličtina |
Rok vydání: | 2011 |
Předmět: |
0106 biological sciences
Systematics Earth and Planetary Sciences(all) Marine life Biology Aquatic Science [SDV.BID.SPT]Life Sciences [q-bio]/Biodiversity/Systematics Phylogenetics and taxonomy 010603 evolutionary biology 01 natural sciences DNA barcoding Demersal zone 14. Life underwater Ecology Evolution Behavior and Systematics Barcode Taxonomy [SDV.GEN.GPO]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Populations and Evolution [q-bio.PE] Ecology 010604 marine biology & hydrobiology Phylogeography Cytochrome oxidase 1 [ SDV.GEN.GPO ] Life Sciences [q-bio]/Genetics/Populations and Evolution [q-bio.PE] CEAMARC Benthic zone Molecular phylogenetics General Earth and Planetary Sciences Taxonomy (biology) [ SDV.BID.SPT ] Life Sciences [q-bio]/Biodiversity/Systematics Phylogenetics and taxonomy |
Zdroj: | Polar Science Polar Science, Elsevier, 2011, 38 (8), pp.298-312. 〈10.1016/j.polar.2011.02.002〉 Polar Science, 2011, 38 (8), pp.298-312. ⟨10.1016/j.polar.2011.02.002⟩ Polar Science, Elsevier, 2011, 38 (8), pp.298-312. ⟨10.1016/j.polar.2011.02.002⟩ |
ISSN: | 1873-9652 |
DOI: | 10.1016/j.polar.2011.02.002〉 |
Popis: | 15 pages; International audience; The Dumont d'Urville Sea (East Antarctic region) has been less investigated for DNA barcoding and molecular taxonomy than other parts of the Southern Ocean, such as the Ross Sea and the Antarctic Peninsula. The Collaborative East Antarctic MARine Census (CEAMARC) took place in this area during the austral summer of 2007e2008. The Australian vessel RSVAurora Australis collected very diverse samples of demersal and benthic organisms. The specimens were sorted centrally, and then distributed to taxonomic experts for molecular and morphological taxonomy and identification, especially barcoding. The COI sequences generated from CEAMARC material provide a sizeable proportion of the Census of Antarctic Marine Life barcodes although the studies are still ongoing, and represent the only source of sequences for a number of species. Barcoding appears to be a valuable method for identification within most groups, despite low divergences and haplotype sharing in a few species, and it is also useful as a preliminary taxonomic exploration method. Several new species are being described. CEAMARC samples have already provided new material for phylogeographic and phylogenetic studies in cephalopods, pycnogonids, teleost fish, crinoids and sea urchins, helping these studies to provide a better insight in the patterns of evolution in the Southern Ocean. |
Databáze: | OpenAIRE |
Externí odkaz: |