T-cell factor 4 and β-catenin chromatin occupancies pattern zonal liver metabolism in mice

Autor: Chiara Sartor, François Guillonneau, Philippe Veber, Laura Bachelot, Anne-Françoise Burnol, Angélique Gougelet, Cyril Torre, Albert Braeuning, Pierre-Damien Denechaud, Christine Perret, Céline Dubuquoy, Michael Schwarz, Cécile Godard, Tao Ye, Sabine Colnot, Marthe Moldes, Benoit Terris
Přispěvatelé: Centre de Recherche des Cordeliers (CRC (UMR_S_1138 / U1138)), École Pratique des Hautes Études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Université Paris Cité (UPCité), Institut Cochin (IC UM3 (UMR 8104 / U1016)), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Génétique et Développement de Rennes (IGDR), Université de Rennes (UR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Département de Physiologie, Université de Montréal (UdeM), Centre de Recherche Saint-Antoine (UMRS893), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service d'Anatomie et de cytologie pathologiques [CHU Cochin], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Cochin [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Plateforme protéomique 3P5 [Institut Cochin] (3P5), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire (IGBMC), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Medical University Graz, Bundesinstitut für Risikobewertung - Federal Institute for Risk Assessment (BfR), École pratique des hautes études (EPHE), GOUGELET, Angélique, Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Université de Paris (UP), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Paris (UP), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique )
Jazyk: angličtina
Rok vydání: 2014
Předmět:
Zdroj: Hepatology
Hepatology, 2014, 59 (6), pp.2344-2357. ⟨10.1002/hep.26924⟩
Hepatology, Wiley-Blackwell, 2014, 59 (6), pp.2344-2357. ⟨10.1002/hep.26924⟩
ISSN: 0270-9139
1527-3350
Popis: β-catenin signaling can be both a physiological and oncogenic pathway in the liver. It controls compartmentalized gene expression, allowing the liver to ensure its essential metabolic function. It is activated by mutations in 20%-40% of hepatocellular carcinomas (HCCs) with specific metabolic features. We decipher the molecular determinants of β-catenin-dependent zonal transcription using mice with β-catenin-activated or -inactivated hepatocytes, characterizing in vivo their chromatin occupancy by T-cell factor (Tcf)−4 and β-catenin, transcriptome, and metabolome. We find that Tcf-4 DNA bindings depend on β-catenin. Tcf-4/β-catenin binds Wnt-responsive elements preferentially around β-catenin-induced genes. In contrast, genes repressed by β-catenin bind Tcf-4 on hepatocyte nuclear factor 4 (Hnf-4)-responsive elements. β-Catenin, Tcf-4, and Hnf-4α interact, dictating β-catenin transcription, which is antagonistic to that elicited by Hnf-4α. Finally, we find the drug/bile metabolism pathway to be the one most heavily targeted by β-catenin, partly through xenobiotic nuclear receptors. Conclusions: β-catenin patterns the zonal liver together with Tcf-4, Hnf-4α, and xenobiotic nuclear receptors. This network represses lipid metabolism and exacerbates glutamine, drug, and bile metabolism, mirroring HCCs with β-catenin mutational activation. (Hepatology 2014;59:2344–2357)
Databáze: OpenAIRE
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