16p13.11 microduplication in 45 new patients: refined clinical significance and genotype–phenotype correlations

Autor: Aziza Lebbar, Sandra Chantot-Bastaraud, Catherine Yardin, Ghislaine Plessis, Patrick Edery, Damien Sanlaville, Laurence Faivre, Aline Receveur, Anne Claude Tabet, Solveig Heide, Laila El Khattabi, Patrick Callier, Christine Francannet, Alice Goldenberg, Eva Pipiras, Michèle Mathieu-Dramard, Chantal Missirian, Odile Boute-Benejean, Cécile Laroche, C. Francois-Fiquet, Pascal Garnier, Alice Masurel-Paulet, Nathalie Marle, Marion Gérard, Jean Michel Dupont, Alexandra Afenjar, Martine Doco Fenzy, Anne Moncla, Marie Pierre Cordier, Brigitte Benzacken, Jean-Hubert Caberg, Gaetan Lesca, Loïc de Pontual, Christine Ioos, Massimiliano Rossi, Nathalie Le Meur, Andrée Delahaye-Duriez, Joris Andrieux, Caroline Vincent-Delorme, Siham Chafai Elalaoui, Lesley Suiro, Philippe Vago, Anne-Laure Mosca-Boidron, Abdelhafid Natiq
Přispěvatelé: Hôpital Cochin [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Université Sorbonne Paris Cité (USPC), Université Paris Descartes - Faculté de Médecine (UPD5 Médecine), Institut Cochin (IC UM3 (UMR 8104 / U1016)), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), [Institut Cochin] Département Développement, Reproduction et Cancer (DRC), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service de génétique, CHU du Sart-Tilman, Laboratoire de Génétique Médicale, Hôpital Jeanne de Flandre [Lille]-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Centre de génétique - Centre de référence des maladies rares, anomalies du développement et syndromes malformatifs (CHU de Dijon), Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), CHU Trousseau [APHP], Unité Fonctionnelle de Génétique Clinique [CHU Pitié Salpétrière], CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Génétique des Anomalies du Développement (GAD), Université de Bourgogne (UB)-IFR100 - Structure fédérative de recherche Santé-STIC, Unité de Génétique Médicale, Hôtel-Dieu-CHU Clermont-Ferrand, CHU Dijon, Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon)-Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), Service de génétique [Rouen], CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU), Laboratoire de cytogénétique (CHU de Dijon), Département de génétique médicale [Hôpital de la Timone - APHM], Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service de génétique médicale, CHU Amiens-Picardie, Service de Génétique [CHU Caen], Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-CHU Caen, Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN), Marseille medical genetics - Centre de génétique médicale de Marseille (MMG), Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hospices Civils de Lyon (HCL), Centre de recherche en neurosciences de Lyon - Lyon Neuroscience Research Center (CRNL), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Hôpital Jean Verdier [AP-HP], Handicaps génétiques de l'enfant (Inserm U393), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Département de génétique, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Robert Debré-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Raymond-Poincaré Hospital, Département de Génétique Médicale [INH Rabat], Institut National d'Hygiène, Rabat, Morocco, Service d'histologie, embryologie et cytogénétique [Béclère], Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-AP-HP - Hôpital Antoine Béclère [Clamart], Equipe de Recherche Médicale Appliquée (ERMA), Université de Limoges (UNILIM)-CHU Limoges-Génomique, Environnement, Immunité, Santé, Thérapeutique (GEIST FR CNRS 3503), BIO-INGENIERIE (XLIM-BIO-INGENIERIE), XLIM (XLIM), Université de Limoges (UNILIM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Limoges (UNILIM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service de Pédiatrie médicale [CHU Limoges], CHU Limoges, Génétique Médicale, CHU Clermont-Ferrand-CHU Estaing [Clermont-Ferrand], CHU Clermont-Ferrand, Imagerie Moléculaire et Stratégies Théranostiques (IMoST), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), Centre Hospitalier Universitaire de Liège (CHU-Liège), Hôpital Jeanne de Flandre [Lille], Centre Hospitalier Universitaire de Reims (CHU Reims), IFR53, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Hôpital Côte de Nacre [CHU Caen], CHU Caen, Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN)-Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), AP-HP Hôpital universitaire Robert-Debré [Paris], Hôpital Raymond Poincaré [AP-HP], Hôpital Maison Blanche, Hôpital Robert Debré, Hôpital Robert Debré-Centre Hospitalier Universitaire de Reims (CHU Reims), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Aix Marseille Université (AMU), Centre de recherche en neurosciences de Lyon (CRNL), Génomique, Environnement, Immunité, Santé, Thérapeutique (GEIST FR CNRS 3503)-Université de Limoges (UNILIM)-CHU Limoges, Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Rok vydání: 2018
Předmět:
Male
0301 basic medicine
Pediatrics
Autism Spectrum Disorder
Developmental Disabilities
Disease
030105 genetics & heredity
Neurodevelopmental disorder
Risk Factors
Gene Duplication
Medicine
Child
Genetics (clinical)
miR-484
3. Good health
Phenotype
Cardiovascular Diseases
Autism spectrum disorder
Child
Preschool
Speech delay
Female
medicine.symptom
Microtubule-Associated Proteins
NDE1
Adult
medicine.medical_specialty
Adolescent
Genetic counseling
MYH11
[SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer
Context (language use)
Young Adult
03 medical and health sciences
Intellectual Disability
mental disorders
Genetics
Humans
Abnormalities
Multiple
Clinical significance
Genetic Association Studies
business.industry
Infant
medicine.disease
neurodevelopmental disorder
16p13.11 duplication
MicroRNAs
030104 developmental biology
[SDV.GEN.GH]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Human genetics
business
Neurocognitive
Chromosomes
Human
Pair 16
Zdroj: Journal of Medical Genetics
Journal of Medical Genetics, BMJ Publishing Group, 2018, ⟨10.1136/jmedgenet-2018-105389⟩
Journal of Medical Genetics, 2018, ⟨10.1136/jmedgenet-2018-105389⟩
ISSN: 1468-6244
0022-2593
Popis: BackgroundThe clinical significance of 16p13.11 duplications remains controversial while frequently detected in patients with developmental delay (DD), intellectual deficiency (ID) or autism spectrum disorder (ASD). Previously reported patients were not or poorly characterised. The absence of consensual recommendations leads to interpretation discrepancy and makes genetic counselling challenging. This study aims to decipher the genotype–phenotype correlations to improve genetic counselling and patients’ medical care.MethodsWe retrospectively analysed data from 16 013 patients referred to 12 genetic centers for DD, ID or ASD, and who had a chromosomal microarray analysis. The referring geneticists of patients for whom a 16p13.11 duplication was detected were asked to complete a questionnaire for detailed clinical and genetic data for the patients and their parents.ResultsClinical features are mainly speech delay and learning disabilities followed by ASD. A significant risk of cardiovascular disease was noted. About 90% of the patients inherited the duplication from a parent. At least one out of four parents carrying the duplication displayed a similar phenotype to the propositus. Genotype–phenotype correlations show no impact of the size of the duplicated segment on the severity of the phenotype. However, NDE1 and miR-484 seem to have an essential role in the neurocognitive phenotype.ConclusionOur study shows that 16p13.11 microduplications are likely pathogenic when detected in the context of DD/ID/ASD and supports an essential role of NDE1 and miR-484 in the neurocognitive phenotype. Moreover, it suggests the need for cardiac evaluation and follow-up and a large study to evaluate the aortic disease risk.
Databáze: OpenAIRE
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