High-Quality Genome Resource of Xanthomonas hyacinthi Generated via Long-Read Sequencing

Autor: Jonathan M. Jacobs, Janet Ziegle, Emily K Luna, Christine Chang, Ralf Koebnik, Stephen P. Cohen, Jillian M. Lang, Perrine Portier, Marion Fischer Le-Saux, Jan E. Leach
Přispěvatelé: Department of Plant Pathology, Ohio State University [Columbus] (OSU), Colorado State University [Fort Collins] (CSU), Pacific Biosciences of California, Institut de Recherche en Horticulture et Semences (IRHS), Université d'Angers (UA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut de Recherche pour le Développement (IRD), The Ohio State University, United States Department of Agriculture National Institute of Food and Agriculture (NIFA) Postdoctoral Fellowship (2018-08122 to S. P. Cohen) and a joint National Science Foundation-NIFA PBI grant (2018-05040 to J. M. Lang, J. E. Leach, and J. M. Jacobs). European Cooperation in Science and Technology (COST) Action CA16107 EuroXanth, Fulbright Scholar Award to Belgium (J. M. Jacobs)., Université d'Angers (UA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-INSTITUT AGRO Agrocampus Ouest, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)
Jazyk: angličtina
Rok vydání: 2020
Předmět:
Zdroj: Plant Disease
Plant Disease, American Phytopathological Society, 2020, pp.PDIS-11-19-2393. ⟨10.1094/PDIS-11-19-2393-A⟩
Plant Disease, 2020, pp.PDIS-11-19-2393. ⟨10.1094/PDIS-11-19-2393-A⟩
ISSN: 0191-2917
DOI: 10.1094/PDIS-11-19-2393-A⟩
Popis: International audience; The bacterial plant pathogen Xanthomonas hyacinthi is the causal agent of yellow disease of Hyacinthus and other ornamental plant genera. There is no available complete genome for X. hyacinthi, limiting basic research for this pathogen. Here, we release a high-quality complete genome sequence for the X. hyacinthi type strain, CFBP 1156. Single-molecule real-time (SMRT) sequencing with a mean coverage of 306× revealed two contigs of 4,918,645 and 44,381 bp in size. This was the first characterized plant-disease-causing species of Xanthomonas and this genome provides a resource to better understand the biology of yellow disease of hyacinth.
Databáze: OpenAIRE