Determination of Carbapenemase Production by BD Phoenix CPO Method in Karbapenem Resistant Klebsiella pneumoniae and Escherichia coli Isolates

Autor: GERGİN, Berrin, AKPOLAT, Nezahat, ÖZCAN, Nida, ALKAN BİLİK, Özge
Rok vydání: 2022
Předmět:
Zdroj: Volume: 12, Issue: 2 273-282
Sakarya Tıp Dergisi
ISSN: 2146-409X
Popis: Aim:Carbapenemase-producing organisms are Gram-negative bacteria that are resistant to most, sometimes all, antibiotics with their carbapenemase enzymes. Rapid and accurate detection of carbapenemases is essential for the early detection and prevention of resistant nosocomial infections.Material and Method:The study included 72 isolates, 64 containing Oxa-48, 6 NDM, 2 NDM+Oxa-48 and 16 isolates without carbapenemase, isolated from various clinical samples sent to the bacteriology unit of ……. University Hospital Central Laboratory between January 2020 and December 2020. Carbapenemase enzyme groups were investigated in isolates with the BD Phoenix CPO Detect (Becton Dickinson, USA) kit.Results:The compatibility of the BD Phoenix CPO Detect test with PCR was 95.3% for Oxa-48 carrying isolates and 100% for those with the NDM gene. The negative predictive rate of the test was 88.8% in all isolates, 83.3% in K. pneumoniae isolates, and 100.0% in E. coli isolates.Conclusion:The usage of the BD Phoenix CPO Detect test, which can detect carbapenemase enzymes , in routine diagnostic laboratories will contribute to the early diagnosis and correct treatment of resistant bacteria.
Amaç:Karbapenemaz üreten organizmalar , içerdikleri karbapenemaz enzimleri ile antibiyotiklerin bir çoğuna, bazen tamamına dirençli Gram negatif bakterilerdir. Karbapenemazların hızlı ve doğru saptanması dirençli hastane enfeksiyonlarının erken tespiti ve yayılımının önlenmesi için gereklidir. Çalışmada Moleküler yöntemle karbapenemaz gen tayini yapılmış Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae İzolatları BD Phoenix CPO Detect (Becton Dickinson, ABD) kiti ile çalışılarak testin karbapenemaz varlığı ve sınıflarını doğru saptayabilme durumu değerlendirilmiştir.Çalışmaya ….. Üniversitesi Hastanesi Merkez Laboratuvarı bakteriyoloji birimine Ocak 2020 – Aralık 2020 tarihleri arasında gönderilen çeşitli klinik örneklerden izole edilen K. pneumoniae ve E. coli suşları dahil edilmiştir. Moleküler test ile İzolatların 64’ü Oxa-48, 6’sı NDM, 2’si NDM+Oxa-48 içerdiği tespit edilen 72 izolat ile karbapenemazlardan KPC, NDM, VIM, OXA-48 ve IMP-1’i içermeyen 16 izolat dahil edilmiştir. K. pneumoniae ve E. coli izolatları matriks aracılı lazer desorpsiyon iyonizasyon uçuş süresi kütle spektrometrisi [“matrix assisted laser desorptionization-time of flight mass spectrophotometry” (MALDI-TOF MS)] (Bruker Daltonics, Almanya) yöntemi ile tanımlanmış ,üretici firma önerileri doğrultusunda BD Phoenix CPO Detect (Becton Dickinson, ABD) kiti ile karbapenemaz durumu araştırılmıştır.Bulgular: BD Phoenix CPO Detect testinin PCR ile uyumu Oxa-48 geni bulunan izolatlar için %95,3, NDM geni bulunanlar için %100 olarak bulunmuştur. Testin negatif prediktif oranı tüm izolatlarda %88,8, K. pneumoniae izolatlarında %83,3, E. coli izolatlarında %100,0 olarak saptanmıştır.Sonuç: Enterobacterales, P.auroginosa, A.baumanii karbapenemaz enzimlerini saptayabilen BD Phoenix CPO Detect testinin rutin tanı laboratuvarlarında kullanılması dirençli bakterilerin erken tanı ve doğru tedavisine katkı sağlayacaktır.
Databáze: OpenAIRE