Draft genome sequence of Mesotoga strain PhosAC3, a mesophilic member of the bacterial order Thermotogales, isolated from a digestor treating phosphogypsum in Tunisia

Autor: Céline Brochier-Armanet, Jean Le Mer, Khaled Fadhlaoui, Moktar Hamdi, Anne Postec, Bernard Ollivier, Marie-Laure Fardeau, Cécile Persillon, Alain Dolla, Wajdi Ben Hania, Gaël Erauso
Přispěvatelé: Institut méditerranéen d'océanologie (MIO), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Toulon (UTLN), Institut National des Sciences Appliquées et de Technologie [Tunis] (INSAT), Bioinformatique, phylogénie et génomique évolutive (BPGE), Département PEGASE [LBBE] (PEGASE), Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558 (LBBE), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558 (LBBE), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'Ecologie et de Technologie Microbiennes (LETMi), Institut National des Sciences Appliquées et de Technologie - Carthage (INSAT Carthage), Laboratoire de chimie bactérienne (LCB), Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Microbiologie de la Méditerranée (IMM), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Toulon (UTLN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Jazyk: angličtina
Rok vydání: 2015
Předmět:
Zdroj: Standards in Genomic Sciences
Standards in Genomic Sciences, 2015, 10, ⟨10.1186/1944-3277-10-12⟩
ISSN: 1944-3277
DOI: 10.1186/1944-3277-10-12⟩
Popis: Mesotoga strain PhosAc3 was the first mesophilic cultivated member of the order Thermotogales. This genus currently contain two described species, M. prima and M. infera. Strain PhosAc3, isolated from a Tunisian digestor treating phosphogypsum, is phylogenetically closely related to M. prima strain MesG1.Ag.4.2T. Strain PhosAc3 has a genome of 3.1 Mb with a G+C content of 45.2%. It contains 3,051 protein-coding genes of which 74.6% have their best reciprocal BLAST hit in the genome of the type species, strain MesG1.Ag.4.2T. For this reason we propose to assign strain PhosAc3 as a novel ecotype of the Mesotoga prima species. However, in contrast with the M. prima type strain, (i) it does not ferment sugars but uses them only in the presence of elemental sulfur as terminal electron acceptor, (ii) it produces only acetate and CO2 from sugars, whereas strain MesG1.Ag.4.2T produces acetate, butyrate, isobutyrate, isovalerate, 2-methyl-butyrate and (iii) sulfides are also end products of the elemental sulfur reduction in theses growth conditions. Electronic supplementary material The online version of this article (doi:10.1186/1944-3277-10-12) contains supplementary material, which is available to authorized users.
Databáze: OpenAIRE
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