Colonization with the enteric protozoa Blastocystis is associated with increased diversity of human gut bacterial microbiota

Autor: Bruno Pereira, Anne-Pauline Bellanger, Dima El Safadi, Alexandre Loywick, Gabriela Certad, Eric Viscogliosi, Françoise Botterel, Patrick Bastien, Sophie Merlin, Amandine Cian, Laurence Delhaes, Céline Nourrisson, Florent Morio, Gaël Even, Ermanno Candolfi, Christelle Morelle, Philippe Poirier, Christophe Audebert, Meja Rabodonirina, Laurence Lachaud, Frédéric Delbac, Guillaume Desoubeaux, Christelle Pomares, Magali Chabé, Ivan Wawrzyniak
Přispěvatelé: Plateforme d'expertises génomiques appliquées aux sciences expérimentales [Lille] (PEGASE-Biosciences), Institut Pasteur de Lille, Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP), Gènes Diffusion [Douai], Centre d’Infection et d’Immunité de Lille - INSERM U 1019 - UMR 9017 - UMR 8204 (CIIL), Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lille-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Unité de biostatistiques, CHU Clermont-Ferrand, Laboratoire Microorganismes : Génome et Environnement (LMGE), Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 (UBP)-Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Maladies infectieuses et vecteurs : écologie, génétique, évolution et contrôle (MIVEGEC), Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud]), Biologie, Génétique et Pathologie des Pathogènes Eucaryotes (MIVEGEC-BioGEPPE), Pathogènes, Environnement, Santé Humaine (EPATH), Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Maladies infectieuses et vecteurs : écologie, génétique, évolution et contrôle (MIVEGEC), Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud]), Service de Pédiatrie, Centre Hospitalier Universitaire [Rennes], Anofel Cryptosporidium National Network, Laboratoire de Parasitologie-Mycologie, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Henri Mondor-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Institut de Parasitologie et de Pathologie Tropicale (IPPTS), Université de Strasbourg (UNISTRA), Pathologies Respiratoires : Protéolyse et Aérosolthérapie, Université de Tours (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Infections Parasitaires : Transmission, Physiopathologie et Thérapeutiques (IP-TPT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Service de Santé des Armées, Hospices Civils de Lyon (HCL), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille)-Université de Lille-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Pasteur de Lille, Université de Tours-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service de Santé des Armées-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Service de parasitologie et mycologie [CHRU de Besançon], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon), Laboratoire Chrono-environnement - CNRS - UBFC (UMR 6249) (LCE), Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Génétique et évolution des maladies infectieuses (GEMI), Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Génétique et évolution des maladies infectieuses (GEMI), Moné, Anne
Jazyk: angličtina
Rok vydání: 2016
Předmět:
0301 basic medicine
MESH: Sequence Analysis
DNA
Blastocystis Infections
Gut flora
Inflammatory bowel disease
MESH: Blastocystis Infections
RNA
Ribosomal
16S
Cluster Analysis
Colonization
MESH: Phylogeny
Phylogeny
Irritable bowel syndrome
2. Zero hunger
Multidisciplinary
MESH: DNA
Ribosomal
biology
Microbiota
3. Good health
MESH: RNA
Ribosomal
16S
[SDV.MP]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology
MESH: Metagenomics
MESH: Blastocystis
DNA
Bacterial
030106 microbiology
DNA
Ribosomal
Article
MESH: Gastrointestinal Microbiome
Microbiology
Clostridia
03 medical and health sciences
MESH: Cross-Sectional Studies
medicine
Humans
MESH: Microbiota
[SDV.MP] Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology
[SDV.EE.SANT]Life Sciences [q-bio]/Ecology
environment/Health
Blastocystis
MESH: Humans
Sequence Analysis
DNA
biology.organism_classification
medicine.disease
MESH: Cluster Analysis
MESH: DNA
Bacterial
Gastrointestinal Microbiome
Gastrointestinal Tract
Cross-Sectional Studies
030104 developmental biology
MESH: Dysbiosis
Dysbiosis
Protozoa
MESH: Gastrointestinal Tract
Metagenomics
Zdroj: Scientific Reports
Scientific Reports, 2016, 6, pp.25255. ⟨10.1038/srep25255⟩
Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2016, 6, pp.25255. ⟨10.1038/srep25255⟩
Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2016, 6 (1), pp.25255. ⟨10.1038/srep25255⟩
ISSN: 2045-2322
DOI: 10.1038/srep25255⟩
Popis: Alterations in the composition of commensal bacterial populations, a phenomenon known as dysbiosis, are linked to multiple gastrointestinal disorders, such as inflammatory bowel disease and irritable bowel syndrome, or to infections by diverse enteric pathogens. Blastocystis is one of the most common single-celled eukaryotes detected in human faecal samples. However, the clinical significance of this widespread colonization remains unclear, and its pathogenic potential is controversial. To address the issue of Blastocystis pathogenicity, we investigated the impact of colonization by this protist on the composition of the human gut microbiota. For that purpose, we conducted a cross-sectional study including 48 Blastocystis-colonized patients and 48 Blastocystis-free subjects and performed an Ion Torrent 16S rDNA gene sequencing to decipher the Blastocystis-associated gut microbiota. Here, we report a higher bacterial diversity in faecal microbiota of Blastocystis colonized patients, a higher abundance of Clostridia as well as a lower abundance of Enterobacteriaceae. Our results contribute to suggesting that Blastocystis colonization is usually associated with a healthy gut microbiota, rather than with gut dysbiosis generally observed in metabolic or infectious inflammatory diseases of the lower gastrointestinal tract.
Databáze: OpenAIRE
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