Determination of RNA stability using reverse transcription real-time PCR

Autor: K. Bílek, Jana Zrůstová, Aleš Knoll
Jazyk: angličtina
Rok vydání: 2008
Předmět:
Zdroj: Acta Universitatis Agriculturae et Silviculturae Mendelianae Brunensis, Vol 56, Iss 4, Pp 219-222 (2008)
ISSN: 2464-8310
1211-8516
Popis: Cilem studie bylo zjistit stabilitu izolovane RNA v různých laboratornich podminkach. Studie byla zaměřena na možne inhibicni vlastnosti vody osetřene diethylpyrocarbonatem (DEPC), dale byl zkouman vliv casu (1, 2, 4, 8, 16, 32 a 64 hodin inkubace) a teploty (20 °C, 4 °C, -20 °C a -80 °C) na degradaci izolovane RNA. Inkubovane vzorky byly nasledně převedeny pomoci reverzni transkripce na cDNA. Jeji množstvi bylo analyzovano pomoci polymerazove řetězove reakce v realnem case (real-time PCR). Dale byl zkouman pouze vliv teploty inkubace nebo elucniho roztoku na degradaci ziskane RNA. Statisticke zhodnoceni výsledků bylo provedeno metodou analýzy variance (ANOVA) a nebyl zjistěn statisticky významný rozdil mezi skupinami vzorků, respektive nedochazelo k významne degradaci RNA mezi pozorovanými skupinami vzorků. Zejmena je důležite zjistěni, že neni významný rozdil degradace RNA uchovavane ve vodě osetřene DEPC a v RNaz proste vodě. Výsledky teto prace jsou použitelne pro veskere molekularni aplikace, ktere pracuji na bazi RNA.
Databáze: OpenAIRE