A web-based tool for rational screening of mutants libraries using ProSAR

Autor: Magali Remaud-Simeon, Philippe Charton, Magali Berland, Bernard Offmann, Isabelle André
Přispěvatelé: Dynamique des Structures et Interactions des Macromolécules Biologiques - Pôle de La Réunion (DSIMB Réunion), Biologie Intégrée du Globule Rouge (BIGR (UMR_S_1134 / U1134)), Institut National de la Transfusion Sanguine [Paris] (INTS)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université de La Réunion (UR)-Université des Antilles (UA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de la Transfusion Sanguine [Paris] (INTS)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université de La Réunion (UR)-Université des Antilles (UA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Laboratoire d'Ingénierie des Systèmes Biologiques et des Procédés (LISBP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Région Réunion, Fond Social Europeen (20100017), Région Pays de la Loire for ReMSIP project (2012-7279-7281), Institut National de la Transfusion Sanguine [Paris] (INTS)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université de La Réunion (UR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe] -Université des Antilles (UA)-Institut National de la Transfusion Sanguine [Paris] (INTS)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université de La Réunion (UR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe] -Université des Antilles (UA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut National de la Transfusion Sanguine [Paris] (INTS)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université de La Réunion (UR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université des Antilles (UA)-Institut National de la Transfusion Sanguine [Paris] (INTS)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université de La Réunion (UR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université des Antilles (UA), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Charton, Philippe, Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Jazyk: angličtina
Rok vydání: 2014
Předmět:
Zdroj: Protein Engineering, Design and Selection
Protein Engineering, Design and Selection, Oxford University Press (OUP), 2014, 27 (10), pp.375-381. ⟨10.1093/protein/gzu035⟩
Protein Engineering, Design and Selection, 2014, 27 (10), pp.375-381. ⟨10.1093/protein/gzu035⟩
ISSN: 1741-0126
1741-0134
Popis: International audience; In directed evolution experiments, it is at stake to have methods to screen efficiently the mutant libraries. We propose a web-based tool that implements an established in silico method for the rational screening of mutant libraries. The method, known as ProSAR, attempts to link sequence data to activity. The method uses statistical models trained on small experimental datasets provided by the user. These can integrate potential epistatic interactions between mutations and be used in many diverse biological contexts. It drastically improves the search for leading mutants. The tool is freely available to non-commercial users at http://bo-protscience.fr/prosar/.
Databáze: OpenAIRE
Externí odkaz: