Gene expression analysis of light‐modulated germination in tomato seeds
| Autor: | Javier Francisco Botto, Gabriela Alejandra Auge, Susana B. Perelman, Rodolfo Augusto Sánchez, Carlos Daniel Crocco |
|---|---|
| Rok vydání: | 2009 |
| Předmět: |
HIGH-IRRADIANCE RESPONSE (HIR)
Light Physiology Germination Plant Science Genes Plant Ciencias Biológicas Transcriptome Solanum lycopersicum Gene Expression Regulation Plant Botany Gene expression TRANSCRIPTOME Promoter Regions Genetic Oligonucleotide Array Sequence Analysis biology Phytochrome Microarray analysis techniques Gene Expression Profiling Reproducibility of Results food and beverages Bioquímica y Biología Molecular PHYTOCHROME biology.organism_classification Cell biology Gene expression profiling LIGHT TOMATO (SOLANUM LYCOPERSICUM) Multigene Family Multivariate Analysis Seeds Dormancy Solanum CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS GERMINATION |
| Zdroj: | New Phytologist. 183:301-314 |
| ISSN: | 1469-8137 0028-646X |
| DOI: | 10.1111/j.1469-8137.2009.02867.x |
| Popis: | Tomato (Solanum lycopersicum) seed germination can be inhibited by continuous irradiation with far-red light (FRc) and re-induced by a subsequent red light pulse. In this study, we carried out a global transcript analysis of seeds subjected to FRc inhibitory treatment, with and without a subsequent red light pulse, using potato cDNA microarrays. We also identified and characterized genes involved in light-modulated germination as elements of the phytochrome signalling pathway. Microarray data showed that the inhibition of germination by FRc involves the induction of a large number of genes and the repression of a significantly smaller quantity. Multivariate analysis established an underlying pattern of expression dependent on physiological treatment and incubation time, and identified different groups of genes associated with dormancy maintenance, inhibition and promotion of germination. We showed that ELIP, CSN6, SOS2 and RBP are related to the photocontrol of germination. These genes are known to participate in other physiological processes, but their participation in germination has not been suggested previously. Light quality regulates the tomato seed transcriptome during phytochrome-modulated germination through changes in the expression of certain sets of genes. In addition, ELIP and GIGANTEA were confirmed as components of the phytochrome A signalling pathway during FRc inhibition of germination. Fil: Auge, Gabriela Alejandra. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Fisiológicas y Ecológicas Vinculadas a la Agricultura. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Agronomía. Instituto de Investigaciones Fisiológicas y Ecológicas Vinculadas a la Agricultura; Argentina Fil: Perelman, Susana Beatriz. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Fisiológicas y Ecológicas Vinculadas a la Agricultura. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Agronomía. Instituto de Investigaciones Fisiológicas y Ecológicas Vinculadas a la Agricultura; Argentina Fil: Crocco, Carlos Daniel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Fisiológicas y Ecológicas Vinculadas a la Agricultura. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Agronomía. Instituto de Investigaciones Fisiológicas y Ecológicas Vinculadas a la Agricultura; Argentina Fil: Sanchez, Rodolfo Augusto. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Fisiológicas y Ecológicas Vinculadas a la Agricultura. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Agronomía. Instituto de Investigaciones Fisiológicas y Ecológicas Vinculadas a la Agricultura; Argentina Fil: Botto, Javier Francisco. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Fisiológicas y Ecológicas Vinculadas a la Agricultura. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Agronomía. Instituto de Investigaciones Fisiológicas y Ecológicas Vinculadas a la Agricultura; Argentina |
| Databáze: | OpenAIRE |
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