RAS mutation analysis in circulating tumor DNA from patients with metastatic colorectal cancer: the AGEO RASANC prospective multicenter study

Autor: Julien Taieb, Romain Coriat, Thomas Aparicio, David Tougeron, J.-M. Gornet, Pierre Laurent-Puig, Valérie Taly, Aurélia Meurisse, Pascal Artru, Olivier Dubreuil, Jean-Baptiste Bachet, Samy Louafi, Hélène Blons, Lysiane Marthey, F. Bonnetain, Thierry Lecomte, Corinne Normand, Anne Thirot-Bidault, Dewi Vernerey, O. Bouche, Magali Garcia, Florence Mary, I. Baumgaertner
Přispěvatelé: Centre Hospitalier Universitaire de Reims (CHU Reims), Unité de Méthodologie et de Qualité de Vie en Cancérologie (UMQVC), Carcinogénèse épithéliale : facteurs prédictifs et pronostiques - UFC (EA 3181) (CEF2P / CARCINO), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Besançon] (CHRU Besançon)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Besançon] (CHRU Besançon)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Pôle cancérologie (CHU Besançon), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Besançon] (CHRU Besançon)-Institut Régional Fédératif du Cancer (IRFC), Centre Scientifique et Technique du Bâtiment (CSTB), Service de Gastroentérologie [CHU Pitié-Salpêtrière], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Sorbonne Université-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université, Clinique Jean-Mermoz, Hôpital privé Jean Mermoz, Amélioration génétique et adaptation des plantes méditerranéennes et tropicales (UMR AGAP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Interactions hôte-greffon-tumeur, ingénierie cellulaire et génique - UFC (UMR INSERM 1098) (RIGHT), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Etablissement français du sang [Bourgogne-Franche-Comté] (EFS [Bourgogne-Franche-Comté]), Hôpital Bicêtre, Hôpital Bicêtre-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11), Centre hospitalier universitaire de Poitiers (CHU Poitiers), Groupe innovation et ciblage cellulaire (GICC), EA 7501 [2018-...] (GICC EA 7501), Université de Tours, Tri ionique par les Systèmes Moléculaires auto-assemblés (LTSM), Institut de Chimie Séparative de Marcoule (ICSM - UMR 5257), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Montpellier (ENSCM)-Université de Montpellier (UM)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Montpellier (ENSCM)-Université de Montpellier (UM), Service d'hépato-gastro-entérologie [Hôpital Saint-Louis], Groupe Hospitalier Saint Louis - Lariboisière - Fernand Widal [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), AP-HP Hôpital Bicêtre (Le Kremlin-Bicêtre), Bases moléculaires de la réponse aux xénobiotiques (U775 (IFR95)), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Médecine Personnalisée, Pharmacogénomique, Optimisation Thérapeutique (MEPPOT - U1147), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service de biostatistique et d'épidémiologie (SBE), Direction de la recherche clinique [Gustave Roussy], Institut Gustave Roussy (IGR)-Institut Gustave Roussy (IGR), Association des Gastroentérologues Oncologues [Paris] (AGEO), CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Department of Digestive Oncology, Hopital Europeen Georges Pompidou, Paris, Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon)-Pôle cancérologie (CHRU Besançon), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon)-Institut Régional Fédératif du Cancer (IRFC), Service d'Hépato-Gastro-Entérologie [CHU Pitié-Salpêtrière], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Service d'oncologie [Hôpital Sud Francilien, Corbeil Essonnes], Hôpital Sud Francilien Corbeil-Essonnes, Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Bicêtre, Service de Gastro-entérologie [Avicenne], Université Paris 13 (UP13)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Avicenne [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), TALY, Valerie, Carcinogénèse épithéliale : facteurs prédictifs et pronostiques - UFC (UR 3181) (CEF2P / CARCINO), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Pôle cancérologie (CHRU Besançon), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon)-Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon)-Institut Régional Fédératif du Cancer (IRFC), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Etablissement français du sang [Bourgogne-Franche-Comté] (EFS [Bourgogne-Franche-Comté])-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Besançon] (CHRU Besançon)-Université de Franche-Comté (UFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Besançon] (CHRU Besançon)-Université de Franche-Comté (UFC)-Pôle cancérologie (CHU Besançon), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-CHU Pitié-Salpêtrière [APHP], Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro), Inserm UMR 1098, Centre Hospitalier Régional Universitaire [Besançon] (CHRU Besançon), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Hôpital Bicêtre, Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Montpellier (ENSCM)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Montpellier (ENSCM)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Besançon] (CHRU Besançon)-Pôle cancérologie (CHU Besançon), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
Jazyk: angličtina
Rok vydání: 2018
Předmět:
0301 basic medicine
Oncology
Adult
Male
medicine.medical_specialty
Colorectal cancer
Concordance
[SDV]Life Sciences [q-bio]
DNA Mutational Analysis
[SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer
Circulating Tumor DNA
03 medical and health sciences
Young Adult
0302 clinical medicine
[SDV.CAN] Life Sciences [q-bio]/Cancer
Predictive Value of Tests
Internal medicine
medicine
Biomarkers
Tumor

[SDV.BBM] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry
Molecular Biology

Humans
[SDV.BBM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry
Molecular Biology

Prospective Studies
Lung cancer
Prospective cohort study
ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Aged
Randomized Controlled Trials as Topic
Aged
80 and over

business.industry
Patient Selection
Liver Neoplasms
Hematology
Odds ratio
Middle Aged
medicine.disease
3. Good health
Clinical trial
[SDV] Life Sciences [q-bio]
030104 developmental biology
030220 oncology & carcinogenesis
Predictive value of tests
ras Proteins
Biomarker (medicine)
Female
business
Colorectal Neoplasms
Zdroj: Annals of Oncology
Annals of Oncology, Elsevier, 2018, 29 (5), pp.1211-1219. ⟨10.1093/annonc/mdy061⟩
Annals of Oncology, Oxford University Press (OUP), 2018, 29 (5), pp.1211-1219. ⟨10.1093/annonc/mdy061⟩
ISSN: 0923-7534
1569-8041
Popis: International audience; Background:RAS mutations are currently sought for in tumor samples, which takes a median of almost 3 weeks in western European countries. This creates problems in clinical situations that require urgent treatment and for inclusion in therapeutic trials that need RAS status for randomization. Analysis of circulating tumor DNA might help to shorten the time required to determine RAS mutational status before anti-epidermal growth factor receptor antibody therapy for metastatic colorectal cancer. Here we compared plasma with tissue RAS analysis in a large prospective multicenter cohort.Patients and methods:Plasma samples were collected prospectively from chemotherapy-naive patients and analyzed centrally by next-generation sequencing (NGS) with the colon lung cancer V2 Ampliseq panel and by methylation digital PCR (WIF1 and NPY genes). Tumoral RAS status was determined locally, in parallel, according to routine practice. For a minimal κ coefficient of 0.7, reflecting acceptable concordance (precision ± 0.07), with an estimated 5% of non-exploitable data, 425 subjects were necessary.Results:From July 2015 to December 2016, 425 patients were enrolled. For the 412 patients with available paired plasma and tumor samples, the κ coefficient was 0.71 [95% confidence interval (CI), 0.64-0.77] and accuracy was 85.2% (95% CI, 81.4% to 88.5%). In the 329 patients with detectable ctDNA (at least one mutation or one methylated biomarker), the κ coefficient was 0.89 (95% CI, 0.84-0.94) and accuracy was 94.8% (95% CI, 91.9% to 97.0%). The absence of liver metastases was the main clinical factor associated with inconclusive circulating tumor DNA results [odds ratio = 0.11 (95% CI, 0.06-0.21)]. In patients with liver metastases, accuracy was 93.5% with NGS alone and 97% with NGS plus the methylated biomarkers.Conclusion:This prospective trial demonstrates excellent concordance between RAS status in plasma and tumor tissue from patients with colorectal cancer and liver metastases, thus validating plasma testing for routine RAS mutation analysis in these patients.Clinical Trial registration:Clinicaltrials.gov, NCT02502656.
Databáze: OpenAIRE