Cabomba as a model for studies of early angiosperm evolution

Autor: Carlos Magdalena, Cédric Finet, Michael Alaux, Charles P. Scutt, Pierre Chambrier, Spencer Brown, Aurélie Chauvet, Fabrice Legeai, Aurélie C. M. Vialette-Guiraud, Paula J. Rudall
Přispěvatelé: Rudall, Paula J., Scutt, Charlie, Unité de Recherche Génomique Info (URGI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes (IGEPP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-AGROCAMPUS OUEST, Scalable, Optimized and Parallel Algorithms for Genomics (GenScale), Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-GESTION DES DONNÉES ET DE LA CONNAISSANCE (IRISA-D7), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - 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Jazyk: angličtina
Rok vydání: 2011
Předmět:
0106 biological sciences
MESH: Genome
Plant
angiosperme
Plant Science
Hydatellaceae
01 natural sciences
c-value
MESH: Nymphaeaceae
Nymphaeales
évolution
MESH: Phylogeny
Phylogeny
0303 health sciences
biology
evo-devo
food and beverages
flowering plant evolution
Biological Evolution
Flowering plant
Cabombaceae
Evolution and Development
Genome
Plant
cabomba
MESH: Biological Evolution
Flowers
010603 evolutionary biology
Models
Biological
03 medical and health sciences
Genetic model
Botany
[SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology
EST
angiosperm
expressed sequence tags
030304 developmental biology
Austrobaileyales
ANA grade
floraison
Nymphaeaceae
Cabomba
fungi
trithuria
MESH: Models
Biological
cabombaceae
15. Life on land
biology.organism_classification
MESH: Flowers
nymphaeales
hybridation in situ
in situ hybridization
hydatellaceae
Zdroj: Annals of Botany 4 (108), . (2011)
Annals of Botany
Annals of Botany, Oxford University Press (OUP), 2011, 108 (4), pp.589-98. ⟨10.1093/aob/mcr088⟩
Annals of Botany, 2011, 108 (4), pp.589-98. ⟨10.1093/aob/mcr088⟩
ISSN: 0305-7364
1095-8290
Popis: International audience; BACKGROUND: The angiosperms, or flowering plants, diversified in the Cretaceous to dominate almost all terrestrial environments. Molecular phylogenetic studies indicate that the orders Amborellales, Nymphaeales and Austrobaileyales, collectively termed the ANA grade, diverged as separate lineages from a remaining angiosperm clade at a very early stage in flowering plant evolution. By comparing these early diverging lineages, it is possible to infer the possible morphology and ecology of the last common ancestor of the extant angiosperms, and this analysis can now be extended to try to deduce the developmental mechanisms that were present in early flowering plants. However, not all species in the ANA grade form convenient molecular-genetic models. SCOPE: The present study reviews the genus Cabomba (Nymphaeales), which shows a range of features that make it potentially useful as a genetic model. We focus on characters that have probably been conserved since the last common ancestor of the extant flowering plants. To facilitate the use of Cabomba as a molecular model, we describe methods for its cultivation to flowering in the laboratory, a novel Cabomba flower expressed sequence tag database, a well-adapted in situ hybridization protocol and a measurement of the nuclear genome size of C. caroliniana. We discuss the features required for species to become tractable models, and discuss the relative merits of Cabomba and other ANA-grade angiosperms in molecular-genetic studies aimed at understanding the origin of the flowering plants.
Databáze: OpenAIRE
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