Modelo hierárquico bayesiano na determinação de associação entre marcadores e QTL em uma população F2
| Autor: | Renato Nunes PEREIRA, Roseli Aparecida LEANDRO, Antonio Augusto Franco GARCIA, Cláudio Lopes SOUZA JUNIOR, Iuri Emmanuel de Paula FERREIRA |
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| Rok vydání: | 2018 |
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| Zdroj: | Repositório Institucional da USP (Biblioteca Digital da Produção Intelectual) Universidade de São Paulo (USP) instacron:USP |
| ISSN: | 1983-0823 |
| DOI: | 10.28951/rbb.v36i2.210 |
| Popis: | O objetivo do mapeamento de QTL (Quantitative Trait Loci} é identificar sua posição no genoma, isto é, identificar em qual cromossomo está e qual sua localização nesse cromossomo, bem como estimar seus efeitos genéticos. Uma vez que as localizações dos QTL não são conhecidas a priori, marcadores são usados frequentemente para auxiliar no seu mapeamento. Alguns marcadores podem estar altamente ligados a um ou mais QTL e, dessa forma eles podem mostrar uma alta associação com a característica fenotípica. Os valores fenotípicos de uma característica quantitativa são normalmente descritos por um modelo linear. Geralmente, um grande número de marcadores são utilizados no modelo linear no processo de associação e dessa forma o modelo especificado contém um número elevado de parâmetros a serem estimados. No entanto, é esperado que muitos destes parâmetros sejam não significativos, necessitando de um tratamento especial. Neste trabalho é proposta a utilização de dois modelos que utilizam distribuições a priori de encolhimento: Lasso Bayesiano e o Estimador Horseshoe. Para avaliar o desempenho dos modelos na determinação da associação entre marcadores e QTL, realizou-se um estudo de simulação. Foi analisada a associação entre marcadores e QTL utilizando a característica fenotípica produção de grãos. A implementação computacional dos algoritmos foi feita utilizando a linguagem C e executada no pacote estatístico R. |
| Databáze: | OpenAIRE |
| Externí odkaz: |
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