Cynomolgus macaque IL37 polymorphism and control of SIV infection

Autor:	Henri-Jean Garchon, Nicolas Tchitchek, Delphine Desjardins, Roger Le Grand, Bruno Vaslin, Takashi Shiina, Nicolas Congy-Jolivet, Nathalie Dereuddre-Bosquet, Brigitte Autran, Ioannis Theodorou, Olivier Lambotte, Antoine Blancher, Alice Aarnink, Shingo Suzuki
Přispěvatelé:	Tokai University, Japan, Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Ingénierie Moléculaire et Physiopathologie Articulaire (IMoPA), Université de Lorraine (UL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Department of Neurology, André Mignot Hospital, University of Versailles, St-Quentin-en-Yvelines, Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Sorbonne Université (SU), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Tokai University, Laboratoire d'Immunogénétique Moléculaire (LIMT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, CHU Toulouse [Toulouse], Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines - UFR Sciences de la santé Simone Veil (UVSQ Santé), Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ), Hôpital Ambroise Paré [AP-HP], Immunologie des Maladies Virales et Autoimmunes (IMVA - U1184), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Infectious Diseases Models for Innovative Therapies (IDMIT), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay, Centre d'Immunologie et des Maladies Infectieuses (CIMI), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service d'Immunologie [CHU Pitié-Salpétrière], CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), AP-HP Hôpital Bicêtre (Le Kremlin-Bicêtre), Centre de Physiopathologie Toulouse Purpan (CPTP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), ANR-11-INBS-0008,IDMIT,Infrastructure nationale pour la modélisation des maladies infectieuses humaines(2011), ANR-10-EQPX-0002,FlowCyTech,Plateforme de phénotypage en Mass cytométrie pour l'analyse multiparamétrique de biomarqueurs complexes de l'efficacité de nouvelles stratégies thérapeutiques ou vaccinales(2010), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Fédératif de Biologie (IFB) - Hôpital Purpan, Hôpital Purpan [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse]-CHU Toulouse [Toulouse], Centre d'investigation clinique de Toulouse (CIC 1436), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-CHU Toulouse [Toulouse]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Infection et inflammation (2I), Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre d'Immunologie et de Maladies Infectieuses (CIMI), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Institut des Maladies Emergentes et des Thérapies Innovantes (IMETI)
Jazyk:	angličtina
Rok vydání:	2019
Předmět:	MESH: Histocompatibility Antigens Class I / immunology Male 0301 basic medicine Candidate gene [SDV]Life Sciences [q-bio] Simian Acquired Immunodeficiency Syndrome Gene Expression lcsh:Medicine MESH: Base Sequence MESH: Linear Models Exon 0302 clinical medicine Polymorphism (computer science) Gene expression Odds Ratio MESH: Animals lcsh:Science MESH: High-Throughput Nucleotide Sequencing ComputingMilieux_MISCELLANEOUS Multidisciplinary MESH: Host-Pathogen Interactions / immunology High-Throughput Nucleotide Sequencing Exons Viral Load MESH: Interleukin-1 / genetics 3. Good health MESH: Histocompatibility Antigens Class I / genetics MESH: Interferon-Stimulated Gene Factor 3 gamma Subunit / immunology Host-Pathogen Interactions [SDV.IMM]Life Sciences [q-bio]/Immunology Simian Immunodeficiency Virus MESH: Interleukin-1 / immunology HIV infections MESH: Host-Pathogen Interactions / genetics MESH: Gene Expression Single-nucleotide polymorphism Biology MESH: Genetic Loci Polymorphism Single Nucleotide MESH: Interferon-Stimulated Gene Factor 3 gamma Subunit / genetics Article 03 medical and health sciences Immunogenetics Animals Gene Base Sequence Histocompatibility Antigens Class I Haplotype lcsh:R [SDV.BBM.BM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry Molecular Biology/Molecular biology MESH: Haplotypes Odds ratio Virology Interferon-Stimulated Gene Factor 3 gamma Subunit Macaca fascicularis 030104 developmental biology Haplotypes [SDV.GEN.GH]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Human genetics Genetic Loci Linear Models lcsh:Q MESH: Exons Sequence Alignment 030217 neurology & neurosurgery Interleukin-1
Zdroj:	Scientific Reports, Vol 9, Iss 1, Pp 1-15 (2019) Scientific Reports Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2019, 9 (1), ⟨10.1038/s41598-019-44235-x⟩ Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2019, 9 (1), pp.7981. ⟨10.1038/s41598-019-44235-x⟩ Scientific Reports, 2019, 9 (1), pp.7981. ⟨10.1038/s41598-019-44235-x⟩
ISSN:	2045-2322
DOI:	10.1038/s41598-019-44235-x
Popis:	The association between gene polymorphisms and plasma virus load at the set point (SP-PVL) was investigated in Mauritian macaques inoculated with SIV. Among 44 macaques inoculated with 50 AID50, six individuals were selected: three with SP-PVL among the highest and three with SP-PVL among the lowest. The exons of 390 candidate genes of these six animals were sequenced. Twelve non-synonymous single nucleotide polymorphisms (NS-SNPs) lying in nine genes potentially associated with PVL were genotyped in 23 animals. Three NS-SNPs with probabilities of association with PVL less than 0.05 were genotyped in a total of 44 animals. One NS-SNP lying in exon 1 of the IL37 gene displayed a significant association (p = 3.33 × 10−4) and a strong odds ratio (19.52). Multiple linear regression modeling revealed three significant predictors of SP-PVL, including the IL37 exon 1 NS-SNP (p = 0.0004) and the MHC Class IB haplotypes M2 (p = 0.0007) and M6 (p = 0.0013). These three factors in conjunction explained 48% of the PVL variance (p = 4.8 × 10−6). The potential role of IL37 in the control of SIV infection is discussed.
Databáze:	OpenAIRE
Externí odkaz:	https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_dedup___::7f10cd764ad05ff00d00a2e63ad53fe4 http://link.springer.com/article/10.1038/s41598-019-44235-x Zobrazit plný text záznamu Plný text ve formátu PDF Plný text ve formátu HTML
Nepřihlášeným uživatelům se plný text nezobrazuje	K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.