Screening of Variants in the Transcript Profile of Eutopic Endometrium from Infertile Women with Endometriosis during the Implantation Window
| Autor: | Michele Gomes Da Broi, Jessica Rodrigues Plaça, Wilson Araújo da Silva Jr, Rui Alberto Ferriani, Paula Andrea Navarro |
|---|---|
| Rok vydání: | 2021 |
| Předmět: |
endometriosis
0301 basic medicine Infertility Candidate gene RNA-sequencing Endometriosis infertilidade Context (language use) Disease medicine.disease_cause Endometrium Andrology 03 medical and health sciences 0302 clinical medicine Pregnancy Humans Medicine Computer Simulation Embryo Implantation Prospective Studies eutopic endometrium Mutation endometriose 030219 obstetrics & reproductive medicine Sequence Analysis RNA business.industry MUTAÇÃO GENÉTICA mutação Obstetrics and Gynecology Gynecology and obstetrics medicine.disease 030104 developmental biology medicine.anatomical_structure sequenciamento de RNA Case-Control Studies RG1-991 Female Receptors Chemokine endométrio eutópico mutation infertility business Infertility Female |
| Zdroj: | Revista Brasileira de Ginecologia e Obstetrícia, Volume: 43, Issue: 6, Pages: 457-466, Published: 06 SEP 2021 Revista Brasileira de Ginecologia e Obstetrícia, Vol 43, Iss 6, Pp 457-466 (2021) Revista Brasileira de Ginecologia e Obstetrícia v.43 n.6 2021 Revista brasileira de ginecologia e obstetrícia Federação Brasileira das Sociedades de Ginecologia e Obstetrícia (FEBRASGO) instacron:FEBRASGO Repositório Institucional da USP (Biblioteca Digital da Produção Intelectual) Universidade de São Paulo (USP) instacron:USP |
| ISSN: | 1806-9339 0100-7203 |
| DOI: | 10.1055/s-0041-1730287 |
| Popis: | Objective Abnormalities in the eutopic endometrium of women with endometriosis may be related to disease-associated infertility. Although previous RNA-sequencing analysis did not show differential expression in endometrial transcripts of endometriosis patients, other molecular alterations could impact protein synthesis and endometrial receptivity. Our aim was to screen for functional mutations in the transcripts of eutopic endometria of infertile women with endometriosis and controls during the implantation window. Methods Data from RNA-Sequencing of endometrial biopsies collected during the implantation window from 17 patients (6 infertile women with endometriosis, 6 infertile controls, 5 fertile controls) were analyzed for variant discovery and identification of functional mutations. A targeted study of the alterations found was performed to understand the data into disease’s context. Results None of the variants identified was common to other samples within the same group, and no mutation was repeated among patients with endometriosis, infertile and fertile controls. In the endometriosis group, nine predicted deleterious mutations were identified, but only one was previously associated to a clinical condition with no endometrial impact. When crossing the mutated genes with the descriptors endometriosis and/or endometrium, the gene CMKLR1 was associated either with inflammatory response in endometriosis or with endometrial processes for pregnancy establishment. Conclusion Despite no pattern of mutation having been found, we ponder the small sample size and the analysis on RNA-sequencing data. Considering the purpose of the study of screening and the importance of the CMKLR1 gene on endometrial Resumo Objetivo Anormalidades no endométrio eutópico de mulheres com endometriose podem estar relacionadas à infertilidade associada à doença. Embora a análise prévia de sequenciamento de RNA não tenha evidenciado expressão diferencial em transcritos endometriais de pacientes com endometriose, outras alterações moleculares poderiam afetar a síntese de proteínas e a receptividade endometrial. Nosso objetivo foi rastrear mutações funcionais em transcritos de endométrios eutópicos de mulheres inférteis com endometriose e de controles durante a janela de implantação. Métodos Os dados do sequenciamento de RNA de biópsias endometriais coletados durante a janela de implantação de 17 pacientes (6 mulheres inférteis com endometriose, 6 controles inférteis, 5 controles férteis) foram analisados para a descoberta de variantes e a identificação de mutações funcionais. Um estudo direcionado das alterações encontradas foi realizado para compreender os dados no contexto da doença. Resultados Nenhuma das variantes identificadas foi comuma outras amostras dentro do mesmo grupo, assim como nenhuma mutação se repetiu entre pacientes com endometriose, controles inférteis e férteis. No grupo de endometriose, foram identificadas nove mutações deletérias preditas, mas apenas uma foi previamente associada a uma condição clínica sem impacto endometrial. Ao cruzar os genes mutados com os descritores endometriose e/ou endométrio, o gene CMKLR1 foi associado a resposta inflamatória na endometriose e a processos endometriais para estabelecimento da gravidez. Conclusão Apesar de nenhum padrão de mutação ter sido encontrado, ponderamos o pequeno tamanho da amostra e a análise dos dados de sequenciamento de RNA. Considerando o objetivo do estudo de triagem e a importância do gene CMKLR1 na modulação endometrial, este poderia ser um gene candidato para estudos adicionais que avaliem mutações no endométrio eutópico de pacientes com endometriose. |
| Databáze: | OpenAIRE |
| Externí odkaz: |
|