Development of MALDI-TOF mass spectrometry for the identification of lice isolated from farm animals

Autor: Didier Raoult, Ahmed Benakhla, Maureen Laroche, Souad Righi, Mohamed Nadir Meguini, Basma Ouarti, Philippe Parola
Přispěvatelé: Vecteurs - Infections tropicales et méditerranéennes (VITROME), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut de Recherche Biomédicale des Armées (IRBA), Aix Marseille Université (AMU), Université Chadli Bendjdid, Mohamed Cherif Messaadia University - Université Mohamed-Chérif Messaadia [Souk Ahras], Microbes évolution phylogénie et infections (MEPHI), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), ANR-10-IAHU-0003,Méditerranée Infection,I.H.U. Méditerranée Infection(2010), European Project, Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut de Recherche Biomédicale des Armées [Brétigny-sur-Orge] (IRBA)
Jazyk: angličtina
Rok vydání: 2020
Předmět:
0301 basic medicine
Mallophaga
Proteomics
Veterinary medicine
Livestock
Veterinary (miscellaneous)
[SDV]Life Sciences [q-bio]
030231 tropical medicine
Mass spectrometry
Poultry
lcsh:Infectious and parasitic diseases
03 medical and health sciences
0302 clinical medicine
[SDV.MHEP.CSC]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Cardiology and cardiovascular system
[SDV.MHEP.MI]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases
Phthiraptera
Animals
MALDI-TOF MS
lcsh:RC109-216
[SDV.MP.PAR]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Parasitology
Ovis
[SDV.MHEP.ME]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Emerging diseases
Sheep
biology
Solenopotes capillatus
Goats
Reproducibility of Results
Lice Infestations
biology.organism_classification
Bovicola bovis
MALDI-TOF Mass Spectrometry
Matrix-assisted laser desorption/ionization
030104 developmental biology
Infectious Diseases
Insect Science
Algeria
Spectrometry
Mass
Matrix-Assisted Laser Desorption-Ionization
comic_books
[SDV.MP.VIR]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Virology
Animal Science and Zoology
Parasitology
Identification (biology)
Cattle
Chickens
Anoplura
comic_books.character
Lice
Research Article
Zdroj: Parasite
Parasite, EDP Sciences, 2020, 27 (28), pp.14. ⟨10.1051/parasite/2020026⟩
Parasite, Vol 27, p 28 (2020)
Parasite, 2020, 27 (28), pp.14. ⟨10.1051/parasite/2020026⟩
ISSN: 1252-607X
1776-1042
DOI: 10.1051/parasite/2020026⟩
Popis: Matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS) is now routinely used for the rapid identification of microorganisms isolated from clinical samples and has been recently successfully applied to the identification of arthropods. In the present study, this proteomics tool was used to identify lice collected from livestock and poultry in Algeria. The MALDI-TOF MS spectra of 408 adult specimens were measured for 14 species, including Bovicola bovis, B. ovis, B. caprae, Haematopinus eurysternus, Linognathus africanus, L. vituli, Solenopotes capillatus, Menacanthus stramineus, Menopon gallinae, Chelopistes meleagridis, Goniocotes gallinae, Goniodes gigas, Lipeurus caponis and laboratory reared Pediculus humanus corporis. Good quality spectra were obtained for 305 samples. Spectral analysis revealed intra-species reproducibility and inter-species specificity that were consistent with the morphological classification. A blind test of 248 specimens was performed against the in-lab database upgraded with new spectra and validated using molecular tools. With identification percentages ranging from 76% to 100% alongside high identification scores (mean = 2.115), this study proposes MALDI-TOF MS as an effective tool for discriminating lice species.Développement de la spectrométrie de masse MALDI-TOF MS pour l’identification de poux isolés d’animaux de ferme.La Spectrométrie de Masse à Temps de Vol par Désorption/Ionisation Laser Assistée après Matrice est maintenant utilisée pour l’identification rapide des microorganismes isolés à partir d’échantillons cliniques et a récemment été appliquée avec succès pour l’identification des arthropodes. Dans cette étude, cet outil protéomique a été utilisé pour identifier les poux prélevés sur le bétail et la volaille en Algérie. Les spectres MALDI-TOF MS de 408 spécimens adultes ont été mesurés pour 14 espèces, dont Bovicola bovis, B. ovis, B. caprae, Haematopinus eurysternus, Linognathus africanus, L. vituli, Solenopotes capillatus, Menacanthus stramineus, Menopon gallinae, Chelopistes meleagridis, Goniocotes gallinae, Goniodes gigas, Lipeurus caponis et Pediculus humanus corporis élevé en laboratoire. Des spectres de bonne qualité ont été obtenus pour 305 échantillons. L’analyse spectrale a révélé une reproductibilité intra-espèce et une spécificité inter-espèces qui concordaient avec la classification morphologique. Un test à l’aveugle de 248 échantillons a été effectué par rapport à la base de données de notre laboratoire mise à niveau avec de nouveaux spectres et validée à l’aide d’outils moléculaires. Avec des pourcentages d’identification allant de 76 à 100 % et des scores d’identification élevés (moyenne : 2,115), cette étude propose MALDI-TOF MS comme un outil efficace pour distinguer les espèces de poux.
Databáze: OpenAIRE
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