Surface plasmon resonance imaging of the conversion of clustered DNA lesions into double strand breaks by Fpg protein
| Autor: | Arnaud Buhot, Thierry Livache, Muriel Jourdan, Julia Pingel, Jean-François Constant |
|---|---|
| Přispěvatelé: | Département de Chimie Moléculaire (DCM), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Chimie pour la Reconnaissance et l’Etude d’Assemblages Biologiques (CREAB), SYstèmes Moléculaires et nanoMatériaux pour l’Energie et la Santé (SYMMES), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Département de Chimie Moléculaire - Ingéniérie et Intéractions BioMoléculaires (DCM - I2BM), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), ANR-11-LABX-0003,ARCANE,Grenoble, une chimie bio-motivée(2011), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA) |
| Jazyk: | angličtina |
| Rok vydání: | 2015 |
| Předmět: |
Biology
Lesion 03 medical and health sciences chemistry.chemical_compound DNA double strand break 0302 clinical medicine abasic site medicine lcsh:TA401-492 [CHIM]Chemical Sciences AP site ComputingMilieux_MISCELLANEOUS 030304 developmental biology 0303 health sciences Oligonucleotide Base excision repair Molecular biology 8-Oxoguanine 3. Good health Fpg chemistry Deoxyribose DNA glycosylase 030220 oncology & carcinogenesis DNA cluster lesion surface plasmon resonance imaging 8-oxoguanine lcsh:Materials of engineering and construction. Mechanics of materials medicine.symptom DNA |
| Zdroj: | AIMS Materials Science, Vol 2, Iss 4, Pp 473-483 (2015) AIMS Materials Science AIMS Materials Science, AIMS Press, 2015, 2 (4), pp.473-483. ⟨10.3934/matersci.2015.4.473⟩ AIMS Materials Science, 2015, 2 (4), pp.473-483. ⟨10.3934/matersci.2015.4.473⟩ |
| ISSN: | 2372-0484 |
| DOI: | 10.3934/matersci.2015.4.473⟩ |
| Popis: | Ionizing radiations induce clustered damage sites known to be severely challenging for the cell's repair machinery. In the present study, we have grafted on a biochip four synthetic oligonucleotide duplexes containing either a single 8-oxoguanine, a single 2'-deoxyribose abasic site or two different clustered damages containing these two lesions on opposite strands. Using a SPR imaging-based DNA array, we qualitatively observed the hierarchy of lesion processing by the base excision repair (BER) enzyme Fpg (Formamidopyrimidine (fapy)-DNA glycosylase). We could notably show that Fpg can convert a cluster of lesions into a potentially lethal double strand break (DSB) and demonstrate that SPR imaging is suitable to investigate the incision steps occurring during the repair process. |
| Databáze: | OpenAIRE |
| Externí odkaz: |
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