Draft genome sequence data of Cercospora kikuchii, a causal agent of Cercospora leaf blight and purple seed stain of soybeans

Autor: Marcelo Facundo Berretta, Mercedes Scandiani, Vinson P. Doyle, Paula Fernández, Sergio Alberto González, Francisco Sautua, Marcelo Anibal Carmona, Maximo Rivarola, Manuela Gordo
Jazyk: angličtina
Rok vydání: 2019
Předmět:
AGRICULTURE
Soja
Genome
NEXT GENERATION SEQUENCING (NGS)
Pathosystem
0302 clinical medicine
Agricultural and Biological Science
FUNGAL PATHOGENS
Fungal pathogens
0303 health sciences
CERCOSPORA KIKUCHII
Multidisciplinary
BIOINFORMATICS
purl.org/becyt/ford/4.4 [https]
food and beverages
Agriculture
Purple Seed Stain
Bioinformática
Secuencia Nucleotídica
Análisis Filogenético
Next generation sequencing (NGS)
Cercospora kikuchii
GenBank
Draft genome
lcsh:R858-859.7
Bioinformatics
Gene prediction
Biology
lcsh:Computer applications to medicine. Medical informatics
Cercospora leaf blight (CLB)
03 medical and health sciences
Cercospora
CERCOSPORA LEAF BLIGHT (CLB)
Phylogenetic Analyses
Botany
Blight
PURPLE SEED STAIN (PSS)
Genomes
lcsh:Science (General)
DRAFT GENOME
030304 developmental biology
Genomas
Mancha Púrpura de la Semilla
Whole genome sequencing
Nucleotide Sequence
biology.organism_classification
Purple seed stain (PSS)
Soybeans
030217 neurology & neurosurgery
purl.org/becyt/ford/4 [https]
lcsh:Q1-390
Zdroj: Data in Brief, Vol 27, Iss, Pp-(2019)
CONICET Digital (CONICET)
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
instacron:CONICET
Data in brief 27: 104693 (Octubre 2019)
INTA Digital (INTA)
Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria
instacron:INTA
Data in Brief
ISSN: 2352-3409
0000-0000
Popis: Cercospora kikuchii (Tak. Matsumoto & Tomoy.) M.W. Gardner 1927 is an ascomycete fungal pathogen that causes Cercospora leaf blight and purple seed stain on soybean. Here, we report the first draft genome sequence and assembly of this pathogen. The C. kikuchii strain ARG_18_001 was isolated from soybean purple seed collected from San Pedro, Buenos Aires, Argentina, during the 2018 harvest. The genome was sequenced using a 2 × 150 bp paired-end method by Illumina NovaSeq 6000. The C. kikuchii protein-coding genes were predicted using FunGAP (Fungal Genome Annotation Pipeline). The draft genome assembly was 33.1 Mb in size with a GC-content of 53%. The gene prediction resulted in 14,856 gene models/14,721 protein coding genes. Genomic data of C. kikuchii presented here will be a useful resource for future studies of this pathosystem. The data can be accessed at GenBank under the accession number VTAY00000000 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/VTAY00000000. Fil: Sautua, Francisco J.. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Agronomía. Departamento de Producción Vegetal. Cátedra de Fitopatología; Argentina Fil: González, Sergio Alberto. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación En Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina Fil: Doyle, Vinson P.. No especifíca; Fil: Berretta, Marcelo Facundo. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro de Investigacion En Ciencias Veterinarias y Agronomicas. Instituto de Agrobiotecnologia y Biologia Molecular. Grupo Vinculado Instituto de Microbiologia y Zoologia Agrigola Al Iabimo | Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Oficina de Coordinacion Administrativa Pque. Centenario. Instituto de Agrobiotecnologia y Biologia Molecular. Grupo Vinculado Instituto de Microbiologia y Zoologia Agrigola Al Iabimo.; Argentina Fil: Gordo, Manuela. Laboratorio Agrícola Río Paraná; Argentina Fil: Scandiani, Mercedes M.. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Agronomía; Argentina Fil: Rivarola, Maximo Lisandro. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación En Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina Fil: Fernandez, Paula del Carmen. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación En Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina Fil: Carmona, Marcelo Anibal. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Agronomía. Departamento de Producción Vegetal. Cátedra de Fitopatología; Argentina
Databáze: OpenAIRE
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