A P-insertion screen identifying novel X-linked essential genes in Drosophila

Autor: Geneviève Gonzy-Treboul, Marc Haenlin, Jean S. Deutsch, David L. Cribbs, Frédérique Peronnet, Pierre Ferrer, Stéphane Noselli, Claude Ardourel, Alain Vincent, Henri-Marc Bourbon, Marie-Francoise Alin, Corinne Benassayag, Jean-Antoine Lepesant
Přispěvatelé: Centre de biologie du développement (CBD), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Institut Jacques Monod (IJM (UMR_7592)), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Laboratoire de Biologie du Développement (LBD), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut de Biologie Paris Seine (IBPS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Génomique et épigénétique des pathologies placentaires (Inserm U709), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Biologie moléculaire et génie génétique (IGBMC), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Laboratoire Bordelais de Recherche en Informatique (LaBRI), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École Nationale Supérieure d'Électronique, Informatique et Radiocommunications de Bordeaux (ENSEIRB)-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2, Institut de Génomique Fonctionnelle (IGF), Université de Montpellier (UM)-Université Montpellier 1 (UM1)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Anatomopathologie Haut-Lévêque (ANATOMOPATHOLOGIE), CHU, Clinical Neurology Oxford (CLINICAL NEUROLOGY), Hospital, Departement /u661 : Endocrinologie, Université Montpellier 1 (UM1)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de synthèse organique (DCSO), École polytechnique (X)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), FLAveur, VIsion et Comportement du consommateur (FLAVIC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-Etablissement National d'Enseignement Supérieur Agronomique de Dijon (ENESAD), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de Biologie structurale, Université de Bordeaux (UB)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École Nationale Supérieure d'Électronique, Informatique et Radiocommunications de Bordeaux (ENSEIRB), École polytechnique (X)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Etablissement National d'Enseignement Supérieur Agronomique de Dijon (ENESAD)-Université de Bourgogne (UB), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Bordeaux (UB)-École Nationale Supérieure d'Électronique, Informatique et Radiocommunications de Bordeaux (ENSEIRB)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Etablissement National d'Enseignement Supérieur Agronomique de Dijon (ENESAD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Centre de biologie du développement ( CBD ), Université Toulouse III - Paul Sabatier ( UPS ), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Institut Jacques Monod ( IJM ), Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire de Biologie du Développement ( LBD ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ), Génomique et épigénétique des pathologies placentaires ( Inserm U709 ), Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Biologie moléculaire et génie génétique ( IGBMC ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Laboratoire Bordelais de Recherche en Informatique ( LaBRI ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -École Nationale Supérieure d'Électronique, Informatique et Radiocommunications de Bordeaux (ENSEIRB)-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2, Institut de Génomique Fonctionnelle ( IGF ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques ( UM2 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Université Montpellier 1 ( UM1 ) -Université de Montpellier ( UM ), Anatomopathologie Haut-Lévêque ( ANATOMOPATHOLOGIE ), Clinical Neurology Oxford ( CLINICAL NEUROLOGY ), Université Montpellier 1 ( UM1 ) -Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques ( UM2 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire de synthèse organique ( DCSO ), École polytechnique ( X ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), FLAveur, VIsion et Comportement du consommateur ( FLAVIC ), Etablissement National d'Enseignement Supérieur Agronomique de Dijon ( ENESAD ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB )
Jazyk: angličtina
Rok vydání: 2002
Předmět:
Male
Embryology
Genetic Linkage
MESH : Animals
Genetically Modified
Genes
Insect
MESH: Genes
Insect
medicine.disease_cause
Lethal
Genome
Animals
Genetically Modified
0302 clinical medicine
MESH : Crosses
Genetic
Genes
Reporter
MESH : Drosophila melanogaster
MESH: Gene Expression Regulation
Developmental
MESH : Female
Developmental
MESH: Animals
MESH : Lac Operon
X chromosome
Genetics
0303 health sciences
Mutation
biology
MESH : Enhancer Elements (Genetics)
MESH: Enhancer Elements (Genetics)
MESH : Genes
Insect
Linkage (Genetics)
Gene Expression Regulation
Developmental
MESH: Lac Operon
MESH : Genes
Reporter
MESH: Crosses
Genetic
3. Good health
Enhancer Elements
Genetic
Drosophila melanogaster
Lac Operon
Female
MESH : X Chromosome
X Chromosome
MESH : Male
Mutagenesis (molecular biology technique)
Genetically Modified
Crosses
MESH: Drosophila melanogaster
MESH: Animals
Genetically Modified
03 medical and health sciences
Genetic
Insertional
medicine
Animals
Enhancer Elements (Genetics)
[SDV.BBM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry
Molecular Biology
Enhancer
Gene
[ SDV.BBM ] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry
Molecular Biology
Reporter
Crosses
Genetic
030304 developmental biology
Reporter gene
MESH : Mutagenesis
Insertional
MESH: X Chromosome
MESH: Genes
Reporter
biology.organism_classification
MESH: Male
Mutagenesis
Insertional
Gene Expression Regulation
Genes
MESH: Mutagenesis
Insertional
MESH : Genes
Lethal
Mutagenesis
Genes
Lethal
MESH : Animals
MESH : Gene Expression Regulation
Developmental
MESH: Genes
Lethal
Insect
MESH: Linkage (Genetics)
MESH: Female
030217 neurology & neurosurgery
MESH : Linkage (Genetics)
Developmental Biology
Zdroj: Mechanisms of Development
Mechanisms of Development, Elsevier, 2002, 110 (1-2), pp.71-83
Mechanisms of Development, Elsevier, 2002, 110 (1-2), pp.71-83. ⟨10.1016/s0925-4773(01)00566-4⟩
Mechanisms of Development, 2002, 110 (1-2), pp.71-83. ⟨10.1016/s0925-4773(01)00566-4⟩
ISSN: 0925-4773
DOI: 10.1016/s0925-4773(01)00566-4⟩
Popis: The recent determination and annotation of the entire euchromatic sequence of the Drosophila melanogaster genome predicted the existence of about 13600 different genes (Science 287 (2000) 2185; http://www.fruitfly.org/annot/index.html). In parallel, the Berkeley Drosophila Genome Project (BDGP) has undertaken systematic P-insertion screens, to isolate new lethals and misexpressing lines. To date, however, the genes of the X chromosome have been under-represented in the screens performed. In order both to characterize several X-linked genes of prime interest to our laboratories and contribute to the collection of lethal P-insertions available to the community, we performed a P-insertion mutagenesis of the X chromosome. Using the PlacW and PGawB P-elements as mutagens, we generated two complementary sets of enhancer-trap lines, l(1)(T)PL and l(1)(T)PG, respectively, which both contain a reporter gene whose developmental expression can be monitored when driven by nearby enhancer sequences. We report here the characterization of 260 new insertions, mapping to 133 different genes or predicted CGs. Of these, 83 correspond to genes for which no lethal mutation had yet been reported. For 64 of those, we could confirm that lethality was solely due to the P-element insertion. The primary molecular data, reporter gene expression patterns (observed in embryos, third instar larvae and adult ovaries) and proposed CG assignment for each strain can be accessed and updated on our website at the following address: http://www-cbd.ups-tlse.fr:8080/screen.
Databáze: OpenAIRE
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