Culture–independent characterization of the bacterioplankton community composition of a mesotrophic reservoir (Embalse Río III, Argentina)
| Autor: | Daniela Polverino, Alejandro Jorge Mariñelarena, Christina B. McCarthy, Rolando Rivera-Pomar |
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| Jazyk: | angličtina |
| Rok vydání: | 2012 |
| Předmět: |
Análisis filogenético
Biología Adnr 16s ADNr 16S Microbiología Actinobacteria purl.org/becyt/ford/1 [https] Ciencias Biológicas ACTINOBACTERIA Biología Celular Microbiología Proteobacteria Ciencias Naturales Photic zone purl.org/becyt/ford/1.6 [https] Ecology Evolution Behavior and Systematics biology Ecology ANÁLISIS FILOGENÉTICO Community structure Bacterioplankton biology.organism_classification Aphotic zone PROTEOBACTERIA CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS Polynucleobacter Acidobacteria |
| Zdroj: | SEDICI (UNLP) Universidad Nacional de La Plata instacron:UNLP CONICET Digital (CONICET) Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas instacron:CONICET |
| Popis: | Este estudio constituye el primer análisis de la estructura de la comunidad del bacterioplancton en un reservorio de agua dulce de Argentina utilizando amplificación completa del gen ADNr 16S. Incluye las relaciones filogenéticas y una descripción del bacterioplacton de las zonas fótica y afótica del Embalse Río III, Córdoba, Argentina. El análisis ecológico clásico indicó que la zona fótica tenía mayor diversidad, mientras que la afótica tenía mayor abundancia y una distribución más uniforme de especies. Sin embargo, cuando se utilizó la información filogenética para comparar las comunidades microbianas de ambas zonas, este análisis indicó que ambos ambientes eran similares y que en ninguno predominaba algún linaje en particular. Los phyla identificados en el Embalse del Río III fueron Acidobacteria, Actinobacteria y Proteobacteria. Las especies dominantes en ambas zonas fueron "Candidatus Planktophila sp.” (clase Actinobacteria) y Polynucleobacter sp. (clase Betaproteobacteria). This study represents the first analysis of the bacterioplankton community structure from an Argentine freshwater reservoir using amplification of the entire 16S rDNA gene. It includes the description and the phylogenetic relationships of the bacterioplankton community from the photic and aphotic layers of the Río III Reservoir in Córdoba, Argentina. The classical ecological approach indicated that the photic layer showed greater diversity and the aphotic layer a more even distribution of species and higher biomass. Nevertheless, when the microbial communities in both layers were compared using phylogenetic information, this analysis indicated that both environments were similar and that neither was enriched for any particular lineage. The phyla present in the Río III reservoir were Acidobacteria, Actinobacteria and Proteobacteria and the two dominant species in both layers were Candidatus Planktophila sp. (class Actinobacteria) and Polynucleobacter sp. (class Betaproteobacteria). Centro Regional de Estudios Genómicos Instituto de Limnología "Dr. Raúl A. Ringuelet" |
| Databáze: | OpenAIRE |
| Externí odkaz: |
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