Demethylation by low-dose 5-aza-2′-deoxycytidine impairs 3D melanoma invasion partially through miR-199a-3p expression revealing the role of this miR in melanoma

Autor: Chantal Etievant, Audrey Delmas, Paola B. Arimondo, Arnaud Pillon, Gilles Favre, Joëlle Riond, Jörg Tost, Arnaud Carrier, Florence Busato, Cécile Desjobert, Antoine Daunay, Diego M. Marzese
Přispěvatelé: Pharmacochimie de la Régulation Epigénétique du Cancer (ETaC), PIERRE FABRE-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de biologie du développement (CBD), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Centre d'Etude du Polymorphisme Humain (CEPH), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut Universitaire d'Hématologie (IUH), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Fondation Jean Dausset, Centre National de Génotypage (CNG), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Laboratoires Pierre Fabre, Laboratoire d'Epigénétique et d'Environnement [Evry] (CNG - CEA), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de Genotypage-Institut de Génomique [Evry], Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse (CRCT), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), PIERRE FABRE-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), John Wayne Cancer Institute [Santa Monica, CA, USA], Chimie biologique épigénétique - Epigenetic Chemical Biology (EpiCBio), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), This work was supported to P.B.A. by Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) [ATIP], Région Midi Pyrenées [Equipe d’Excellence and FEDER CNRS/Région Midi Pyrenées], Fondation InNaBioSanté, and PlanCancer2014 (N°EPIG201401)., Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Fondation Jean Dausset-Institut Universitaire d'Hématologie (IUH), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Institut Pasteur [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Riond, Joelle
Jazyk: angličtina
Rok vydání: 2019
Předmět:
0301 basic medicine
Lung Neoplasms
[SDV]Life Sciences [q-bio]
lcsh:Medicine
MESH: Spheroids
Cellular
Transcriptome
Mice
chemistry.chemical_compound
0302 clinical medicine
MESH: DNA Methylation
MESH: Up-Regulation
MESH: Sequence Analysis
RNA
Gene Regulatory Networks
MESH: Animals
Promoter Regions
Genetic
Melanoma
Genetics (clinical)
MESH: Gene Regulatory Networks
DNA methylation
microRNA
MESH: Gene Expression Regulation
Neoplastic
Up-Regulation
3. Good health
Gene Expression Regulation
Neoplastic
[SDV] Life Sciences [q-bio]
MESH: Cell Survival
030220 oncology & carcinogenesis
Female
Deoxycytidine
Epigenetics
MESH: Cell Line
Tumor
lcsh:QH426-470
Cell Survival
MESH: Melanoma
education
Biology
Decitabine
03 medical and health sciences
MESH: Gene Expression Profiling
In vivo
Cell Line
Tumor
Spheroids
Cellular
MESH: Promoter Regions
Genetic
Genetics
medicine
Animals
Humans
Neoplasm Invasiveness
Molecular Biology
MESH: Mice
neoplasms
MESH: Humans
MESH: Decitabine
Sequence Analysis
RNA
Research
Gene Expression Profiling
lcsh:R
MESH: Neoplasm Invasiveness
medicine.disease
Demethylating agent
MESH: Lung Neoplasms
lcsh:Genetics
MicroRNAs
030104 developmental biology
chemistry
Cancer research
Melanoma aggressiveness
MESH: Female
MESH: MicroRNAs
Neoplasm Transplantation
MESH: Neoplasm Transplantation
Developmental Biology
Zdroj: Clinical Epigenetics
Clinical Epigenetics, BioMed Central, 2019, 11 (1), pp.9. ⟨10.1186/s13148-018-0600-2⟩
Clinical Epigenetics, 2019, 11 (1), pp.9. ⟨10.1186/s13148-018-0600-2⟩
Clinical Epigenetics, Vol 11, Iss 1, Pp 1-14 (2019)
ISSN: 1868-7083
DOI: 10.1186/s13148-018-0600-2⟩
Popis: Background Efficient treatments against metastatic melanoma dissemination are still lacking. Here, we report that low-cytotoxic concentrations of 5-aza-2′-deoxycytidine, a DNA demethylating agent, prevent in vitro 3D invasiveness of metastatic melanoma cells and reduce lung metastasis formation in vivo. Results We unravelled that this beneficial effect is in part due to MIR-199A2 re-expression by promoter demethylation. Alone, this miR showed an anti-invasive and anti-metastatic effect. Throughout integration of micro-RNA target prediction databases with transcriptomic analysis after 5-aza-2′-deoxycytidine treatments, we found that miR-199a-3p downregulates set of genes significantly involved in invasion/migration processes. In addition, analysis of data from melanoma patients showed a stage- and tissue type-dependent modulation of MIR-199A2 expression by DNA methylation. Conclusions Thus, our data suggest that epigenetic- and/or miR-based therapeutic strategies can be relevant to limit metastatic dissemination of melanoma. Electronic supplementary material The online version of this article (10.1186/s13148-018-0600-2) contains supplementary material, which is available to authorized users.
Databáze: OpenAIRE
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