Microbial diversity in contaminated soils along the T22 trench of the Chernobyl experimental platform

Autor: Sviatoslav Levchuk, Catherine Berthomieu, Laurie Piette, Claire Le Marrec, Laureline Février, Frederic Coppin, C Sergeant, Richard Christen, A. Martin-Garin, Marie-Hélène Vesvres, Virginie Chapon, Nicolas Theodorakopoulos
Přispěvatelé: Institut de Biosciences et Biotechnologies d'Aix-Marseille (ex-IBEB) (BIAM), Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Biologie végétale et microbiologie environnementale - UMR7265 (BVME), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Interactions Protéine Métal (IPM), RAEN, Centre d'Etudes Nucléaires de Bordeaux Gradignan (CENBG), Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Radioprotection et de Sûreté Nucléaire (IRSN), Unité de Recherche Oenologie [Villenave d'Ornon], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bordeaux (UB)-Institut des Sciences de la Vigne et du Vin (ISVV), Université de Nice, Parc Valrose, 06034 Nice, France, Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA), Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Université Côte d'Azur (UCA)-Université Côte d'Azur (UCA), Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1 (UB)-Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1 (UB)-Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1 (UB)-Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Œnologie, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Victor Segalen - Bordeaux 2, Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS)
Jazyk: angličtina
Rok vydání: 2012
Předmět:
Zdroj: Applied Geochemistry
Applied Geochemistry, Elsevier, 2012, 27 (7), pp.1375-1383. ⟨10.1016/j.apgeochem.2011.08.011⟩
Applied Geochemistry, Elsevier, 2012, 27, pp.1375-1383. ⟨10.1016/j.apgeochem.2011.08.011⟩
Applied Geochemistry, 2012, 27 (7), pp.1375-1383. ⟨10.1016/j.apgeochem.2011.08.011⟩
ISSN: 0883-2927
Popis: International audience; The diversity of bacterial communities exposed to radioactive contamination in Chernobyl soils was examined by a combination of molecular and culture-based approaches. A set of six radioactive soil samples , exhibiting high levels of 137 Cs contamination, were collected from the T22 trench. Three samples were also collected in nearby soils with low contamination. Complex bacterial community structures were observed in both highly and weakly contaminated samples, using a molecular approach targeting the 16S rRNA gene. However, the presence of specific populations within samples from highly contaminated soils could not be revealed by statistical analysis of the DGGE profiles. More than 200 culturable isolates, representative of dominant morphotypes, were grouped into 83 Operational Taxonomic Units (OTUs) and affiliated to Firmicutes, Actinobacteria, Alpha-, Beta-, Gamma-Proteobacteria and Bacteroïdetes. No specific pattern linked to contamination was observed for these culturable bacteria. The results show that both highly and weakly contaminated soils host a wide diversity of bacteria, suggesting that long term exposure to radionuclides does not lead to the extinction of bacterial diversity.
Databáze: OpenAIRE
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