Crystal structures of a group II intron lariat primed for reverse splicing

Autor: Eric Westhof, Hélène Walbott, Maria Costa, François Michel, Dario Monachello
Přispěvatelé: Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Les introns de groupe II en tant que ribozymes et rétrotransposons (RibozyMo), Département Biologie des Génomes (DBG), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Structure et dynamique des ARN (RNAStr), Architecture et Réactivité de l'ARN (ARN), Institut de biologie moléculaire et cellulaire (IBMC), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), French Agence Nationale de la Recherche [ANR-10-BLAN-1502], ANR-10-BLAN-1502,GRP2CONF,Remaniements conformationnels des ribozymes de groupe II(2010), Institut de Biologie Intégrative de la Cellule ( I2BC ), Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ), Université Paris Sud (Paris 11), Université Paris-Saclay, Commissariat à l'Energie Atomique et aux Energies Alternatives, UMR 1403 Institut des Sciences des Plantes de Paris Saclay, Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ), UPR9002, Architecture et Réactivité de l'ARN, Université de Strasbourg ( UNISTRA ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS )
Jazyk: angličtina
Rok vydání: 2016
Předmět:
0301 basic medicine
Spliceosome
transcriptase
Stereochemistry
RNA Splicing
[SDV]Life Sciences [q-bio]
binding sites
Exonic splicing enhancer
Biology
Crystallography
X-Ray
active-site
03 medical and health sciences
Protein splicing
Minor spliceosome
Catalytic Domain
RNA Precursors
metal-ion
RNA
Catalytic
[SDV.BBM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry
Molecular Biology
[SDV.BBM.BC]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry
Molecular Biology/Biochemistry [q-bio.BM]
Genetics
Multidisciplinary
[ SDV ] Life Sciences [q-bio]
[SDV.BBM.BS]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry
Molecular Biology/Structural Biology [q-bio.BM]
GIR1 branching ribozyme
Intron
catalytic step
[SDV.BBM.BM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry
Molecular Biology/Molecular biology
Exons
Group II intron
pre-messenger-rna
Introns
exon-binding
[SDV.BBM.BP]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry
Molecular Biology/Biophysics
030104 developmental biology
[SDV.MP]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology
RNA splicing
Biocatalysis
Spliceosomes
Nucleic Acid Conformation
recognition
2nd step
spliceosome
Zdroj: Science
Science, 2016, 354 (6316), pp.1-9. ⟨10.1126/science.aaf9258⟩
Science, American Association for the Advancement of Science, 2016, 354 (6316), pp.1-9. ⟨10.1126/science.aaf9258⟩
Science, American Association for the Advancement of Science, 2016, 354 (6316), pp.1-9. 〈10.1126/science.aaf9258〉
ISSN: 0036-8075
1095-9203
Popis: Tie me up, cut me down Group II in trons are mobile genetic elements found in all domains of life. They are large ribozymes that can excise themselves from host RNA. Costa et al. determined the structure of an excised group II intron in its branched conformation. This conformation is comparable to the branched “lariat” seen during the splicing of nuclear RNA transcripts. The lariat conformation helps assemble the group II active site for the reverse splicing reaction. The lariat in spliceosomal splicing may also have a similar role in the second step of messenger RNA intron removal. Science , this issue p. 10.1126/science.aaf9258
Databáze: OpenAIRE
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