Estimation of dairy goat body composition: A direct calibration and comparison of eight methods

Autor: Mathieu Monziols, Yannick Le Cozler, Dominique Heimo, Anne de la Torre, Philippe Faverdin, C. Loncke, Sylvain Lerch, Isabelle Chery, Caroline Xavier, Loïc Louis, J.A.A. Pires, Philippe Schmidely, Philippe Lamberton, Christophe Huau
Přispěvatelé: Agroscope, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), IFIP institut du porc, 35650 Le Rheu, France, Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), SILVA (SILVA), AgroParisTech-Université de Lorraine (UL)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Département Ecologie, Physiologie et Ethologie (DEPE-IPHC), Institut Pluridisciplinaire Hubert Curien (IPHC), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Modélisation Systémique Appliquée aux Ruminants (MoSAR), AgroParisTech-Université Paris-Saclay-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), AGROSCOPE POSIEUX CHE, Partenaires IRSTEA, Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA), Institut du Porc (IFIP), International Federation for Information Processing [Laxenburg, Austria] (IFIP), Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Paris-Saclay, Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), Institut Technique du Porc [Le Rheu] (ITP [Le Rheu]), Institut Technique du Porc (ITP), Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), AgroParisTech-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Paris-Saclay, INRAE Université Clermont Auvergne, École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Institut du Porc, Département PEGASE [LBBE] (PEGASE), Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558 (LBBE), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), INRAE Université de Lorraine, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech
Jazyk: angličtina
Rok vydání: 2020
Předmět:
Cell diameter
Computer tomography
residual standard deviation
[SDV]Life Sciences [q-bio]
Adipose cell size
isotope ratio mass spectrometry
Xc
DM
computer-tomography
Ultrasonography
0303 health sciences
residual coefficient of variation
ultrasound
Chemistry
Goats
030302 biochemistry & molecular biology
Ultrasound
D 2 O
BCS
Dilution
Dairying
Milk
Adipose Tissue
Deuterium oxide
Body Composition
Female
CV
Composition (visual arts)
standard deviation
Bioelectrical impedance spectroscopy
3D
CT
rSD
Residual standard deviation
empty body
Ruminant
three-dimension
D 2 OS
General Biochemistry
Genetics and Molecular Biology
resistance
body weight
03 medical and health sciences
Imaging
Three-Dimensional
Animal science
Body condition score
3D imaging
bioelectrical impedance spectroscopy
Calibration
Animals
Lactation
Body Weights and Measures
adipose cell diameter
rCV
BW
Molecular Biology
SD
030304 developmental biology
US
EB
body condition score
business.industry
reactance
BIS
deuterium oxide dilution space
Body chemical composition
IRMS
coefficient of variation
Ruminant Body chemical composition 3D imaging Computer tomography Adipose cell size Deuterium oxide Abbreviations: ACD
dry matter
Tomography
X-Ray Computed
business
Zdroj: Methods
Methods, Elsevier, In press, ⟨10.1016/j.ymeth.2020.06.014⟩
Methods, Elsevier, 2020, ⟨10.1016/j.ymeth.2020.06.014⟩
Methods, Elsevier, 2021, 186, pp.68-78. ⟨10.1016/j.ymeth.2020.06.014⟩
ISSN: 1046-2023
1095-9130
Popis: International audience; The objective was to compare eight methods for estimation of dairy goat body composition, by calibrating against chemical composition (water, lipid, protein, mineral and energy) measured post-mortem. The methods tested on 20 Alpine goats were body condition score (BCS), 3-dimension imaging (3D) automatic assessment of BCS or whole body scan, ultrasound, computer tomography (CT), adipose cell diameter, deuterium oxide dilution space (D 2 OS) and bioelectrical impedance spectroscopy (BIS). Regressions were tested between predictive variates derived from the methods and empty body (EB) composition. The best equations for estimation of EB lipid mass included BW combined with i) perirenal adipose tissue mass and cell diameter (R 2 = 0.95, residual standard deviation, rSD = 0.57 kg), ii) volume of fatty tissues measured by CT (R 2 = 0.92, rSD = 0.76 kg), iii) D 2 OS (R 2 = 0.91, rSD = 0.85 kg), and iv) resistance at infinite frequency from BIS (R 2 = 0.87, rSD = 1.09 kg). The D 2 OS combined with BW provided the best equation for EB protein mass (R 2 = 0.97, rSD = 0.17 kg), whereas BW alone provided a fair estimate (R 2 = 0.92, rSD = 0.25 kg). Sternal BCS combined with BW provided good estimation of EB lipid and protein mass (R 2 = 0.80 and 0.95, rSD = 1.27 and 0.22 kg, respectively). Compared to manual BCS, BCS by 3D slightly decreased the precision of the predictive equation for EB lipid (R 2 = 0.74, rSD = 1.46 kg), and did not improve the estimation of EB protein compared with BW alone. Ultrasound measurements and whole body 3D imaging methods were not satisfactory estimators of body composition (R 2 ≤ 0.40). Further developments in body composition techniques may contribute for high-throughput phenotyping of robustness.
Databáze: OpenAIRE
Externí odkaz: