Variación y estructura genética de Caranx hippos(Teleostei: Carangidae) en el Caribe de Colombia
Autor: | Itala Ivonne Caiafa Hernandez, Arturo Acero Pizarro, Juan Carlos Narváez Barandica |
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Jazyk: | angličtina |
Rok vydání: | 2017 |
Předmět: |
mtDNA control region
education.field_of_study Panmixia Genetic diversity crevalle jack estructura poblacional Population population structure mitochondrial DNA ADN mitocondrial Biology Nucleotide diversity citocromo oxidasa I -COI Evolutionary biology Genetic structure Genetic variation genetic variability Variabilidad genética Genetic variability General Agricultural and Biological Sciences education |
Zdroj: | Revista de Biología Tropical; Vol. 66 No. 1 (2018): Volume 66 – Regular number 1 – March 2018; 122-135 Revista de Biología Tropical; Vol. 66 Núm. 1 (2018): Volumen 66 – Número regular 1 – Marzo 2018; 122-135 Revista Biología Tropical; Vol. 66 N.º 1 (2018): Volumen 66 – Número regular 1 – Marzo 2018; 122-135 Portal de Revistas UCR Universidad de Costa Rica instacron:UCR Revista de Biología Tropical, Volume: 66, Issue: 1, Pages: 122-135, Published: MAR 2018 |
ISSN: | 2215-2075 0034-7744 |
DOI: | 10.15517/rbt.v66i1 |
Popis: | Studies based on molecular genetics offer the possibility to understand the structure of populations and provide data to implement measures designed to protect them. Caranx hippos, is a fish with a wide distribution in the Western Atlantic, becoming one of the most economically important species in the artisanal fishing industry in Colombia. However, little is known about its biology. The present study aimed to evaluate the variation and genetic structure of C. hippos in the Colombian Caribbean by analyzing the mitochondrial DNA region control and cytochrome oxidase subunit (COI). We sequenced the DNA of 153 muscle samples collected from specimens obtained from six fishing ports. The results showed 21 haplotypes for COI and 116 haplotypes for the control region, divided into two lineages that do not exhibit a pattern of geographical distribution. For mitochondrial control region, the estimated haplotype diversity (Hd) presented relatively high values (Hd = 0.99 and = 0.1), while for COI results were Hd = 0.68 and = 0.01; the relationship between haplotype and nucleotide diversity and the neutrality test revealed that C. hippos experienced bottlenecking and a subsequent rapid population expansion. Estimates of genetic structure were low and insignificant, indicating no differentiation between samples collected from geographical isolation. This suggests that for the Colombian Caribbean there is a panmictic population of C. hippos. However, variations were found at population levels, especially in La Guajira, Turbo and San Antero, which, when compared to those included for Brazil and México, demonstrated that unique haplotypes in La Guajira are more aligned to the Brazilian populations, by means of the influence of the Caribbean Current, whilst those from Turbo and San Antero are more frequent in haplotypes originating from Mexico. Future studies should focus the understanding of these processes. Estudios basados en genética molecular son de gran importancia ya que ofrecen la posibilidad de conocer la estructura de las poblaciones y proporcionar datos científicos para la implementación de normas tendientes a protegerlas. El jurel aleta amarilla Caranx hippos es considerado una de las principales especies objeto de la pesquería artesanal en aguas colombianas; sin embargo, es poco lo que se conoce en cuanto a su estructura poblacional. En este sentido, el presente estudio propuso evaluar la variación genética y estructura genética en el Caribe colombiano a partir del análisis de la región control y la región codificante para citocromo c oxidasa subunidad I del ADN mitocondrial. Para esto, se secuenció el ADN de 153 muestras de músculo recolectadas de ejemplares desembarcados en seis puertos pesqueros en el Caribe de Colombia. Los resultados mostraron 21 haplotipos para COI y 116 haplotipos con región control, distribuidos en dos linajes que no presentan un patrón de distribución geográfica. Para la región control la diversidad genética fue alta (Hd=0.99 y π = 0.1), mientras que para COI los resultados fueron Hd=0.68 y π =0.01, esto mostró que probablemente C. hippos pasó por un evento que provocó la disminución drástica de la población y posteriormente tuvo un crecimiento rápido. Las estimaciones del grado de estructuración genética fueron bajas y poco significativas indicando la ausencia de diferenciación entre las muestras recolectadas a partir de un aislamiento geográfico, esto sugiere que la población de C. hippos es panmictica; sin embargo, se hallaron variaciones a nivel intrapoblacional especialmente en La Guajira, Turbo y San Antero, los cuales al ser comparados con los haplotipos incluidos de Brasil y México se encontró que el único haplotipo hallado en La Guajira está alineado con el de Brasil, evento facilitado probablemente por la corriente del Caribe, mientras que los de Turbo y San Antero con los de México. |
Databáze: | OpenAIRE |
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