In silico optimization of lipid production in Rhodosporidium toruloides by gene knockout strategies
| Autor: | Hernán De Battista, Claudio Enrique Voget, María Teresita Castañeda, Sebastián Nuñez |
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| Rok vydání: | 2019 |
| Předmět: |
GENE KNOCKOUT STRATEGIES
0209 industrial biotechnology In silico Mutant MICROBIAL LIPIDS Rhodosporidium toruloides INGENIERÍAS Y TECNOLOGÍAS 02 engineering and technology METABOLIC ENGINEERING RHODOSPORIDIUM TORULOIDES Metabolic engineering 020901 industrial engineering & automation 0202 electrical engineering electronic engineering information engineering Otras Ingeniería Eléctrica Ingeniería Electrónica e Ingeniería de la Información Gene Ingeniería Eléctrica Ingeniería Electrónica e Ingeniería de la Información Gene knockout biology Chemistry 020208 electrical & electronic engineering Lipid metabolism biology.organism_classification Biochemistry Control and Systems Engineering Biodiesel production OPTKNOCK |
| Zdroj: | IFAC-PapersOnLine. 52:94-99 |
| ISSN: | 2405-8963 |
| DOI: | 10.1016/j.ifacol.2019.06.043 |
| Popis: | Microbial lipids are being extensively studied as an alternative to vegetable oils in biodiesel production. For the biotechnological production of biolipids, efficient processes capable of obtaining significant biomass productivity with high lipid titer are required. In this work, we used the Optknock algorithm for the assessment of non-intuitive knockouts using a metabolic model for lipid production in R. toruloides. Four computationally designed mutants were obtained by the deletion of the genes involved in PGI1, GDH1, IDH and IDP1 reactions. In these strains, lipid metabolism is fully coupled to growth, with maximum productivities ranging from 26 to 62% of lipids. By analyzing the maximum yield together with the flux distribution obtained from different knockouts, it was concluded that the double knockout strategy was an interesting alternative for obtaining growth-linked lipid production with few genetic manipulations. Fil: Castañeda, María Teresita. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Centro de Investigación y Desarrollo en Fermentaciones Industriales. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Centro de Investigación y Desarrollo en Fermentaciones Industriales; Argentina. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ingeniería. Departamento de Electrotecnia. Laboratorio de Electrónica Industrial, Control e Instrumentación; Argentina. Universidad Tecnológica Nacional. Facultad Reg.la Plata. Departamento de Ingeniería Química; Argentina Fil: Nuñez, Sebastián. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ingeniería. Departamento de Electrotecnia. Laboratorio de Electrónica Industrial, Control e Instrumentación; Argentina Fil: Voget, Claudio Enrique. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Centro de Investigación y Desarrollo en Fermentaciones Industriales. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Centro de Investigación y Desarrollo en Fermentaciones Industriales; Argentina Fil: de Battista, Hernán. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ingeniería. Departamento de Electrotecnia. Laboratorio de Electrónica Industrial, Control e Instrumentación; Argentina |
| Databáze: | OpenAIRE |
| Externí odkaz: |
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