Overlapping local and long-range RNA-RNA interactions modulate dengue virus genome cyclization and replication
| Autor: | Leopoldo German Gebhard, Sergio Villordo, Andrea V. Gamarnik, Claudia Veronica Filomatori, Luana de Borba, Nestor Gabriel Iglesias |
|---|---|
| Jazyk: | angličtina |
| Rok vydání: | 2015 |
| Předmět: |
Untranslated region
DNA Replication Gene Expression Regulation Viral Rna-Rna Interaction viruses Immunology Molecular Sequence Data RNA-dependent RNA polymerase Replication Genome Viral Biology Dengue virus medicine.disease_cause Microbiology Ciencias Biológicas Dengue purl.org/becyt/ford/1 [https] Viral entry Virology Viral structural protein medicine Coding region Animals Regulatory Elements Transcriptional purl.org/becyt/ford/1.6 [https] 3' Untranslated Regions Genetics Base Sequence Flavivirus RNA Dengue Virus Genome Replication and Regulation of Viral Gene Expression Culicidae Viral replication Insect Science Nucleic Acid Conformation RNA Viral Capsid Proteins Virología CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS |
| Zdroj: | CONICET Digital (CONICET) Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas instacron:CONICET |
| Popis: | The dengue virus genome is a dynamic molecule that adopts different conformations in the infected cell. Here, using RNA folding predictions, chemical probing analysis, RNA binding assays, and functional studies, we identified new cis-acting elements present in the capsid coding sequence that facilitate cyclization of the viral RNA by hybridization with a sequence involved in a local dumbbell structure at the viral 3' untranslated region (UTR). The identified interaction differentially enhances viral replication in mosquito and mammalian cells. Fil: de Borba, Luana. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires. Fundación Instituto Leloir. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires; Argentina Fil: Villordo, Sergio. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires. Fundación Instituto Leloir. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires; Argentina Fil: Iglesias, Nestor Gabriel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires. Fundación Instituto Leloir. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires; Argentina Fil: Filomatori, Claudia Veronica. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires. Fundación Instituto Leloir. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires; Argentina Fil: Gebhard, Leopoldo German. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires. Fundación Instituto Leloir. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires; Argentina Fil: Gamarnik, Andrea Vanesa. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires. Fundación Instituto Leloir. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires; Argentina |
| Databáze: | OpenAIRE |
| Externí odkaz: |
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