Determining Genetic Variation of Calpastatin Gene with MspI and NcoI Enzymes by Using PCR-RFLP Method in Kivircik Lambs

Autor: Kozet Avanus
Jazyk: angličtina
Rok vydání: 2017
Předmět:
Zdroj: Volume: 44, Issue: 1 39-43
Acta Veterinaria Eurasia
ISSN: 2618-639X
2619-905X
Popis: Bu çalışmanın amacı Kıvırcık kuzulardaPCR-RFLP yöntemi ile MspI ve NcoI enzimleri kullanılarak kalpastatin geniningenetik çeşitliliğini belirlemektir. Kırklareli ilinde bulunan sekiz farklıçiftlikten toplanan Kıvırcık kuzularının (n=153) kan örnekleri DNA izolasyonu içinkullanılmıştır. PCR amplifikasyonundan sonra, ürünler %2’lik ve %3’lük agarozjel elektroforezinde M ve N allellerini ayırt etmek için MspI ve NcoI enzimleriile kesilmiştir. M ve N allellerinin frekansı MspI lokusunda sırasıyla %88,2 ve%11,8, NcoI lokusunda %98,7 ve %1,3 olarak bulunmuştur. MspI lokusu için MM, MNve NN genotiplerinin frekansları sırasıyla 0,77, 0,22 ve 0,01 olarak tespitedilmiştir. NcoI lokusu için MM ve MN genotiplerinin frekansları sırasıyla 0,97ve 0,03 olarak belirlenmiştir, NN genotipi ise gözlenmemiştir. Gözlenenheterozigotluk MspI lokusu için (0,22), NcoI lokusundan (0,03) daha yüksekolarak bulunmuştur. Kırklareli ilinde yetiştirilen Kıvırcık kuzuları MspI veNcoI lokusları için Hardy-Weinberg dengesinde bulunmuştur.
The aim of this study was to determine thegenetic variation of calpastatin gene by using PCR-RFLP method with MspI andNcoI enzymes in Kivircik lambs. Blood samples of Kivircik lambs (n=153) thatwere collected from eight different farms located in Kirklareli province, wereused for DNA isolation. After PCR amplification, products were digested withMspI and NcoI enzymes to differentiate M and N alleles on 2% and 3% agarose gelelectrophoresis. The frequency of M and N alleles were found 88.2% and 11.8%for MspI locus and 98.7% and 1.3% for NcoI locus respectively. The frequenciesof MM, MN and NN genotypes were identified 0.77, 0.22 and 0.01 respectively forMspI locus. The frequencies of MM and MN genotypes were determined 0.97 and0.03 respectively for NcoI locus, NN genotype was not observed. Observed heterozygositywas higher in MspI (0.22) than NcoI locus (0.03). MspI and NcoI loci were foundin Hardy-Weinberg equilibrium in Kivircik lambs raised in Kirklareli province.
Databáze: OpenAIRE
Externí odkaz: