Isolation and complete genome sequencing of rabies virus strain isolated from a brown bear (Ursus arctos) that attacked a human in Primorsky krai (November, 2014)
| Autor: | M Y, Shchelkanov, A A, Deviatkin, V Y, Ananiev, E V, Frolov, I E, Dombrovskaya, V G, Dedkov, A V, Ardashev, S A, Kolomeets, I P, Korotkova, E N, Lyubchenko, V V, Bandeev, M N, Prosyannikova, I V, Galkina, E S, Ivanushko, N P, Emelyanova, N I, Baranov, S A, Ulyanova, S V, Aramilev, P V, Fomenko, A L, Surovy, N A, Poroshin, N N, Sokol, D V, Maslov, E E, Makhinya, G A, Shipulin |
|---|---|
| Rok vydání: | 2016 |
| Předmět: | |
| Zdroj: | Problems of Virology. 61:180-186 |
| ISSN: | 2411-2097 0507-4088 |
| DOI: | 10.18821/0507-4088-2016-61-4-180-186 |
| Popis: | An attack of a brown bear (Ursus arctos) on human was detected in November, 2014 in the Barabash village (Khasan region of the Primorski krai) located in close proximity to the national park Land of the Leopard. The bear was shot. The deviant behavior of the bear indicated the possibility of rabies. The diagnosis was confirmed by means of laboratory methods. The strain RABV/Ursus arctos/Russia/Primorye/PO 01/2014 (further PO 01) was isolated from the brain of the bear. PO 01 is the first completely sequenced Far Eastern strain of RABV. It can be considered as topotypic. PO 01 considerably differs from the vaccine strain RV 97 (GenBank EF542830) that is the basis of attenuated vaccine applied in the Land of the Leopard. At the same time, the immunodominant sites in PO 01 and RV 97 proteins differ slightly. It can be recommended to continue application of the vaccine. The analysis of the PO 01 genome (GenBank KP997032) revealed its belonging to the Eurasian genetic subgroup of the genotype 1 (street rage). Thus, this genetic subgroup stretches to the East. Expansion of the cross-border protected territories of Russia and China in the Far East demands the correct statistics of circulation of the lyssaviruses to be kept.В ноябре 2014 г. в с. Барабаш (Хасанский район Приморского края), расположенном в непосредственной близости к национальному парку «земля леопарда», произошло нападение бурого медведя (Ursus arctos) на человека. Девиантное поведение медведя позволило предположить бешенство, которое было подтверждено после его отстрела с помощью лабораторных методов. из головного мозга медведя был изолирован штамм RABV/Ursus arctos/Russia/Primorye/PO-01/2014 (далее - PO-01). Штамм PO-01 является первым полностью секвенированным дальневосточным штаммом вируса бешенства и может считаться топотипным. PO-01 значительно отличается от вакцинного штамма RV-97 (СепеВапк EF542830), на основе которого выпускается живая аттенуированная вакцина, применявшаяся для профилактики бешенства в «Земле леопарда». Вместе с тем иммунодоминантные сайты в белках PO-01 и RV-97 отличаются незначительно, и применение вакцины может быть рекомендовано к продолжению. Анализ генома PO-01 (СепеВапк KP997032) выявил его принадлежность к евразийской генетической подгруппе генотипа 1 (уличного бешенства). Таким образом, эта генетическая подгруппа распространяется на восток вплоть до окраины материка. Расширение трансграничных охраняемых территорий России и Китая на Дальнем Востоке требует корректного учета циркуляции лиссавирусов. |
| Databáze: | OpenAIRE |
| Externí odkaz: |
|